RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 OR4A4PQ8NGN8 299 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 SGMS2Q8NHU3 365 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 C15orf40Q8WUR7 153 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 SSMEM1Q8WWF3 244 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.01□□□□□ -1.13
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GGA3-209ENST00000580646 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 YPEL2Q96QA6 119 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 MMP28Q9H239 520 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 MMP27Q9H306 513 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 AUNIPQ9H7T9 357 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 ZNRD1Q9P1U0 126 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 ADAM30Q9UKF2 790 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 POMT1Q9Y6A1 747 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 TRAV18A0A075B6X5 111 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 A0A0U1RQK1 487 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 FAM181BA6NEQ2 426 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 PCP4L1A6NKN8 68 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 HPGDSO60760 199 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 SNAPINO95295 136 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 CRYBA1P05813 215 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 ELK1P19419 428 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 NFYBP25208 207 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 HTR1DP28221 377 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 CEACAM3P40198 252 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 DYNLT3P51808 116 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 ZNF137PP52743 207 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 TAS2R20P59543 309 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 MORN2Q502X0 79 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 C4orf46Q504U0 113 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 SHISA2Q6UWI4 295 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 ZNF439Q8NDP4 499 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 OR1L1Q8NH94 360 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 RFESDQ8TAC1 157 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 CABLES2Q9BTV7 478 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 CCDC32Q9BV29 185 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 CHIAQ9BZP6 476 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 GHITMQ9H3K2 345 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 OR2S2Q9NQN1 319 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 PSG11Q9UQ72 335 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 FAM96BQ9Y3D0 163 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 ZNF98A6NK75 572 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 LEUTXA8MZ59 168 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 LY6LH3BQJ8 138 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 SULT1C2O00338 296 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 CTDSP2O14595 271 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 FABP7O15540 132 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 SSX5O60225 188 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 HLA-DQB1P01920 261 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 CTXN2P0C2S0 81 aa7.99□□□□□ -1.13
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GGA3-209ENST00000580646 ZBTB25P24278 435 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 RAB25P57735 213 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 TCTE3Q8IZS6 198 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 PRR18Q8N4B5 295 aa7.99□□□□□ -1.13
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GGA3-209ENST00000580646 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 DPM3Q9P2X0 92 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 GNG12Q9UBI6 72 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 A0A1B0GUS0 222 aa7.98□□□□□ -1.13
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GGA3-209ENST00000580646 A0A1W2PRM7 423 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 TXNL1O43396 289 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 IGHV4-59P01825 116 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 SCTP09683 121 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 IL3RAP26951 378 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 PRSS3P35030 304 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 IER3P46695 156 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 ARHGDIBP52566 201 aa7.98□□□□□ -1.13
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GGA3-209ENST00000580646 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 CNIH2Q6PI25 160 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 HOGA1Q86XE5 327 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 OR4F5Q8NH21 305 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 OR5R1Q8NH85 324 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 MCFD2Q8NI22 146 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 SNAPC3Q92966 411 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 MIXL1Q9H2W2 232 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-209ENST00000580646 DPAGT1Q9H3H5 408 aa7.98□□□□□ -1.13
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