RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550078.2

ZBED6-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED6, Length 12,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6-202ENST00000550078 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ZBED6-202ENST00000550078 CLDN18P56856 261 aa4.55□□□□□ -1.68
ZBED6-202ENST00000550078 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ZBED6-202ENST00000550078 VRK3Q8IV63 474 aa4.55□□□□□ -1.68
ZBED6-202ENST00000550078 OR52N1Q8NH53 320 aa4.55□□□□□ -1.68
ZBED6-202ENST00000550078 TP53RKQ96S44 253 aa4.55□□□□□ -1.68
ZBED6-202ENST00000550078 MAP1LC3AQ9H492 121 aa4.55□□□□□ -1.68
ZBED6-202ENST00000550078 TMEM106BQ9NUM4 274 aa4.55□□□□□ -1.68
ZBED6-202ENST00000550078 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.55□□□□□ -1.68
ZBED6-202ENST00000550078 ZNF488Q96MN9 340 aa4.55□□□□□ -1.68
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ZBED6-202ENST00000550078 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
ZBED6-202ENST00000550078 HIST1H3AP68431 136 aa4.55□□□□□ -1.68
ZBED6-202ENST00000550078 OR52N4Q8NGI2 321 aa4.55□□□□□ -1.68
ZBED6-202ENST00000550078 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa4.55□□□□□ -1.68
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ZBED6-202ENST00000550078 A0A087X0M5 115 aa4.55□□□□□ -1.68
ZBED6-202ENST00000550078 A0A1B0GX30 115 aa4.55□□□□□ -1.68
ZBED6-202ENST00000550078 TEX22C9J3V5 150 aa4.55□□□□□ -1.68
ZBED6-202ENST00000550078 IGKV1D-33P01593 117 aa4.55□□□□□ -1.68
ZBED6-202ENST00000550078 IGKV1-33P01594 117 aa4.55□□□□□ -1.68
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ZBED6-202ENST00000550078 DGCR2P98153 550 aa4.55□□□□□ -1.68
ZBED6-202ENST00000550078 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.684e-13■■■□□ 18.9
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ZBED6-202ENST00000550078 TXNDC17Q9BRA2 123 aa4.55□□□□□ -1.68
ZBED6-202ENST00000550078 CELA3AP09093 270 aa4.54□□□□□ -1.68
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ZBED6-202ENST00000550078 FANCD2OSQ96PS1 177 aa4.54□□□□□ -1.68
ZBED6-202ENST00000550078 PRADC1Q9BSG0 188 aa4.54□□□□□ -1.68
ZBED6-202ENST00000550078 LEUTXA8MZ59 168 aa4.54□□□□□ -1.68
ZBED6-202ENST00000550078 OSMP13725 252 aa4.54□□□□□ -1.68
ZBED6-202ENST00000550078 CLDN20P56880 219 aa4.54□□□□□ -1.68
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ZBED6-202ENST00000550078 HIST3H3Q16695 136 aa4.54□□□□□ -1.68
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ZBED6-202ENST00000550078 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa4.54□□□□□ -1.68
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ZBED6-202ENST00000550078 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa4.54□□□□□ -1.68
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ZBED6-202ENST00000550078 ZNF485Q8NCK3 441 aa4.54□□□□□ -1.68
ZBED6-202ENST00000550078 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ZBED6-202ENST00000550078 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
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ZBED6-202ENST00000550078 A0A096LNI7 61 aa4.54□□□□□ -1.68
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ZBED6-202ENST00000550078 TMEM160Q9NX00 188 aa4.54□□□□□ -1.68
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ZBED6-202ENST00000550078 ERVK-7P63135 1459 aa4.53□□□□□ -1.68
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ZBED6-202ENST00000550078 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.685e-6■■■□□ 16.4
ZBED6-202ENST00000550078 C10orf113Q5VZT2 155 aa4.53□□□□□ -1.68
ZBED6-202ENST00000550078 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa4.53□□□□□ -1.68
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