RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM131AQ6UXB0 335 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MOB1BQ7L9L4 216 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR6M1Q8NGM8 313 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRR25Q96S07 402 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC23A1Q9UHI7 598 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCOCQ9UIL1 159 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB29O14966 203 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDUFA3O95167 84 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UCHL1P09936 223 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RUNX1Q01196 453 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF260Q3ZCT1 412 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR1N2Q8NGR9 330 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0A6YYD4 124 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 I3L521 148 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR8U8P0C7N1 319 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LIPKQ5VXJ0 399 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UFD1Q92890 307 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR5B12Q96R08 314 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB9AP51151 201 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF616Q08AN1 781 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL39P5Q59GN2 51 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MINDY2Q8NBR6 621 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM203Q969S6 136 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LPAR5Q9H1C0 372 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR5H14A6NHG9 310 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOCS1O15524 211 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CT45A6P0DMU7 189 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CT45A5P0DMU8 189 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CT45A7P0DMV0 189 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNB1P62873 340 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IRF3Q14653 427 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 P2RY14Q15391 338 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABHD14BQ96IU4 210 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GHITMQ9H3K2 345 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXL15Q9H469 300 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLGRKTQ9HBL7 147 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AK3Q9UIJ7 227 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITGB1BP1O14713 200 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RRHO14718 337 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARSBP15848 533 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MC5RP33032 325 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDPQ00604 133 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLGLAQ15195 96 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ECSCRQ19T08 205 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASPHD1Q5U4P2 390 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H7C2Y5 167 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INSL3P51460 131 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HLA-DRB3P79483 266 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM89BQ8N5H3 189 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EDARADDQ8WWZ3 215 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR1A1Q9P1Q5 309 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MGAT4AQ9UM21 535 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WASHC3Q9Y3C0 194 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPRKBQ9Y3C4 175 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXO7Q9Y3I1 522 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1W2PN81 502 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H0YJW9 148 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC17A2O00624 439 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSPA12AO43301 675 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSMCR30P0CW71 290 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB25P24278 435 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHRNA7P36544 502 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEACAM6P40199 344 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CX3CL1P78423 397 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C19orf54Q5BKX5 351 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM91Q6ZNR0 172 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GFI1Q99684 422 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AGMATQ9BSE5 352 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSF4Q9ULV5 492 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A3GALT2U3KPV4 340 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD65E5RJM6 399 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBBP9O75884 186 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARL6IP5O75915 188 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPS25P62851 125 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPBGQ13641 420 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAM1Q15629 374 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB11BQ15907 218 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR5AN1Q8NGI8 311 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABHD5Q8WTS1 349 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C12orf4Q9NQ89 552 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.4 ms