RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 KCTD7Q96MP8 289 aa5.08□□□□□ -1.6
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HOXD8-202ENST00000429017 JAM3Q9BX67 310 aa5.08□□□□□ -1.6
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HOXD8-202ENST00000429017 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
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HOXD8-202ENST00000429017 CT45A1Q5HYN5 189 aa5.06□□□□□ -1.6
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HOXD8-202ENST00000429017 ZNF491Q8N8L2 437 aa5.06□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 OR1N2Q8NGR9 330 aa5.06□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 CT45A3Q8NHU0 189 aa5.06□□□□□ -1.6
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HOXD8-202ENST00000429017 DCUN1D4Q92564 292 aa5.06□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 ARL11Q969Q4 196 aa5.06□□□□□ -1.6
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HOXD8-202ENST00000429017 PEX16Q9Y5Y5 336 aa5.06□□□□□ -1.6
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HOXD8-202ENST00000429017 NAT1P18440 290 aa5.05□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 VDAC1P21796 283 aa5.05□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 SOX2P48431 317 aa5.05□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 KCNJ3P48549 501 aa5.05□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF137PP52743 207 aa5.05□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 PPP5CP53041 499 aa5.05□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 RBM11P57052 281 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 RUNX1Q01196 453 aa5.05□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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