RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 MGAT4AQ9UM21 535 aa16.07■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa16.06■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 IFITM5A6NNB3 132 aa16.06■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 RGS5O15539 181 aa16.06■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 NAPSAO96009 420 aa16.06■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 ARSBP15848 533 aa16.06■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 CD33P20138 364 aa16.06■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 UNC119Q13432 240 aa16.06■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 HMGN3Q15651 99 aa16.06■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 NKAPLQ5M9Q1 402 aa16.06■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 ZNF880Q6PDB4 577 aa16.06■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 Q8N9W7 124 aa16.06■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 SULT4A1Q9BR01 284 aa16.06■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa16.06■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 PLSCR3Q9NRY6 295 aa16.06■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa16.06■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 ADAM30Q9UKF2 790 aa16.06■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 HSF4Q9ULV5 492 aa16.06■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 SLC31A2O15432 143 aa16.05■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 PF4P02776 101 aa16.05■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 OR10K2Q6IF99 312 aa16.05■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 FAM71F2Q6NXP2 309 aa16.05■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 C6orf201Q7Z4U5 140 aa16.05■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 STPG2Q8N412 459 aa16.05■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 OR51D1Q8NGF3 324 aa16.05■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 OR10V1Q8NGI7 309 aa16.05■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 S1PR3Q99500 378 aa16.05■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 FAAP24Q9BTP7 215 aa16.05■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 PLGRKTQ9HBL7 147 aa16.05■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa16.04■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 ITGB1BP1O14713 200 aa16.04■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 TEX38Q6PEX7 206 aa16.04■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa16.04■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 GFI1Q99684 422 aa16.04■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 RASL11BQ9BPW5 248 aa16.04■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 LPAR5Q9H1C0 372 aa16.04■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 NECAP2Q9NVZ3 263 aa16.04■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 COMMD3Q9UBI1 195 aa16.04■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 STEAP1Q9UHE8 339 aa16.04■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 A0A1W2PRX2 142 aa16.03■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 CTDSP2O14595 271 aa16.03■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 GPR12P47775 334 aa16.03■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 SCAND1P57086 179 aa16.03■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 ZNF846Q147U1 533 aa16.03■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 OXLD1Q5BKU9 147 aa16.03■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 SPANXN2Q5MJ10 180 aa16.03■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 C10orf99Q6UWK7 81 aa16.03■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 OR2AK2Q8NG84 335 aa16.03■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 OR52L2PQ8NGH6 319 aa16.03■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 PIPOXQ9P0Z9 390 aa16.03■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 ZNF45Q02386 682 aa16.02■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 RAB11BQ15907 218 aa16.02■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa16.02■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 HES5Q5TA89 166 aa16.02■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa16.02■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 ZNF329Q86UD4 541 aa16.02■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 ODF3L1Q8IXM7 274 aa16.02■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 CMTM3Q96MX0 182 aa16.02■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 NICN1Q9BSH3 213 aa16.02■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 GPR61Q9BZJ8 451 aa16.02■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 AKIP1Q9NQ31 210 aa16.02■□□□□ 0.16
PITX3-201ENST00000370002 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 ETV6P41212 452 aa16.01■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 RNF152Q8N8N0 203 aa16.01■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 SPATA2Q9UM82 520 aa16.01■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 ETV7Q9Y603 341 aa16.01■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 TGP01266 2768 aa16.01■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 IGF1P05019 195 aa16■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 ELANEP08246 267 aa16■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 OR5H8P0DN80 308 aa16■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 TNFSF8P32971 234 aa16■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa16■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 CCDC190Q86UF4 302 aa16■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 LAX1Q8IWV1 398 aa16■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 OR56B1Q8NGI3 324 aa16■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 PHF21AQ96BD5 680 aa16■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 FAM3DQ96BQ1 224 aa16■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 A0A0A6YYD4 124 aa16■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 RAB29O14966 203 aa16■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 HPGDSO60760 199 aa16■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 MYCNOSP40205 109 aa16■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 FOXE3Q13461 319 aa16■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 GNMTQ14749 295 aa16■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 SAMD12Q8N8I0 201 aa16■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 EDARADDQ8WWZ3 215 aa16■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 NABP2Q9BQ15 211 aa16■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 C12orf4Q9NQ89 552 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms