RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	NBR2	O15453	112 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	SPINT2	O43291	252 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	LY6G6C	O95867	125 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	HLA-DRB1	P01911	266 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	PLGLA	Q15195	96 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	C12orf73	Q69YU5	71 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	ELP2	Q6IA86	826 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	LIN54	Q6MZP7	749 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511		Q8N1X5	172 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	STX19	Q8N4C7	294 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	RFK	Q969G6	155 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	NRBF2	Q96F24	287 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	NSL1	Q96IY1	281 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	S100A13	Q99584	98 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	CST11	Q9H112	138 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	RETN	Q9HD89	108 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	DHDH	Q9UQ10	334 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	DAPL1	A0PJW8	107 aa		8.29	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	ZAR1L	A6NP61	321 aa		8.29	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	C15orf65	H3BRN8	121 aa		8.29	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	AIP	O00170	330 aa		8.29	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	8.29	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	ORC5	O43913	435 aa		8.29	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	FKBP6	O75344	327 aa		8.29	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV1-51	P01701	117 aa		8.29	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	TPPP2	P59282	170 aa		8.29	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	8.29	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	PAX5	Q02548	391 aa		8.29	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF85	Q03923	595 aa		8.29	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	8.29	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		8.29	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZRM9	215 aa		8.29	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		8.29	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		8.29	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	PXT1	Q8NFP0	134 aa		8.29	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	8.29	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	MS4A10	Q96PG2	267 aa		8.29	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	MED4	Q9NPJ6	270 aa		8.29	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		8.29	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		8.29	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF150	Q9ULK6	438 aa		8.29	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	ING4	Q9UNL4	249 aa		8.29	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511		J3QLW9	94 aa		8.28	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	GABRP	O00591	440 aa		8.28	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC16A6	O15403	523 aa		8.28	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF19	P17023	458 aa		8.28	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB3A	P20336	220 aa		8.28	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	CNTFR	P26992	372 aa		8.28	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	EPHA2	P29317	976 aa		8.28	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	CCR9	P51686	369 aa		8.28	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	EFNB1	P98172	346 aa		8.28	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	FLOT2	Q14254	428 aa		8.28	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		8.28	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511		Q3ZCU0	254 aa		8.28	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		8.28	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		8.28	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	THTPA	Q9BU02	230 aa		8.28	□□□□□ -1.08
SKAP2-209	ENST00000497511	LANCL1	O43813	399 aa		8.27	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	CDRT1	O95170	752 aa		8.27	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	ZP3	P21754	424 aa		8.27	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF137P	P52743	207 aa		8.27	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB40B	Q12829	278 aa		8.27	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	TMED1	Q13445	227 aa		8.27	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	8.27	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		8.27	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTBL2	Q562R1	376 aa		8.27	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		8.27	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	C6orf183	Q5T699	404 aa		8.27	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	OR52N1	Q8NH53	320 aa		8.27	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		8.27	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		8.27	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	8.27	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	8.27	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	METTL9	Q9H1A3	318 aa		8.27	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		8.27	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		8.27	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		8.27	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	HERC2	O95714	4834 aa		8.27	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		8.26	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511		G3V2T6	193 aa		8.26	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	8.26	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	SOX15	O60248	233 aa		8.26	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	RGS11	O94810	467 aa		8.26	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	HBZ	P02008	142 aa		8.26	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	MT-ND4	P03905	459 aa		8.26	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	TRGV3	P03979	118 aa		8.26	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	8.26	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINA2	P20848	420 aa		8.26	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	CALB2	P22676	271 aa		8.26	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	VHL	P40337	213 aa		8.26	□□□□□ -1.09
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF134	P52741	427 aa		8.26	□□□□□ -1.09

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