RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452550.5

SH3BGR-208, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene SH3BGR, Length 865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BGR-208	ENST00000452550	SLC35A2	P78381	396 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	HES1	Q14469	280 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	PIGY	Q3MUY2	71 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	RAB12	Q6IQ22	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550		Q6P435	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550		Q8NFD4	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	LINC01006	Q8NI28	216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	TOMM40L	Q969M1	308 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	ARL11	Q969Q4	196 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	MGLL	Q99685	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	CENPO	Q9BU64	300 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	DUSP21	Q9H596	190 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	C16orf95	Q9H693	158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	ODF3B	A8MYP8	253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	TXNL1	O43396	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	ORC5	O43913	435 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	ATP6V1G2	O95670	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	ARSB	P15848	533 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	CRHBP	P24387	322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	CD34	P28906	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	DLX1	P56177	255 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	DLX6	P56179	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	GABARAPL2	P60520	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	PAX5	Q02548	391 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	TPBG	Q13641	420 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	ARL6IP1	Q15041	203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	RAB11B	Q15907	218 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	LTC4S	Q16873	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550		Q3ZCU0	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550		Q6ZSV7	163 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR8H3	Q8N146	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	RFESD	Q8TAC1	157 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	FCGR1B	Q92637	280 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	PHF21A	Q96BD5	680 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	MMP28	Q9H239	520 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A087X0M5	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A1B0GX30	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550		J3QR06	171 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550	CCRL2	O00421	344 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550	HSPA12A	O43301	675 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550	PDCD6	O75340	191 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550	MT-ND4	P03905	459 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550	OPN1MW	P04001	364 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550	UCHL1	P09936	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550	GADD45A	P24522	165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550	GNG10	P50151	68 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550	FHL3	Q13643	280 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550	HERPUD1	Q15011	391 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550	HCP5	Q6MZN7	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SH3BGR-208	ENST00000452550	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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