RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427778.1

LINC00963-204, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00963, Length 382 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-204ENST00000427778 CT45A3Q8NHU0 189 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 UBALD1Q8TB05 177 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 CAPSLQ8WWF8 208 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 GALMQ96C23 342 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 CYYR1Q96J86 154 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 YPEL2Q96QA6 119 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 MMP27Q9H306 513 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 OR2S2Q9NQN1 319 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 RAB22AQ9UL26 194 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 MGAT4AQ9UM21 535 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 STUB1Q9UNE7 303 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 A0A1W2PPE3 182 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 ITGB1BP1O14713 200 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 SLC31A2O15432 143 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 LANCL1O43813 399 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 RGS11O94810 467 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 DIRAS3O95661 229 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 LPLP06858 475 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 IGHV3-43DP0DP04 118 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 RAB3BP20337 219 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 CD1BP29016 333 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 ZNF134P52741 427 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM50BP56557 158 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 CLDN12P56749 244 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 OR10A3P58181 314 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 C22orf42Q6IC83 251 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 Q6ZS46 218 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 ABRACLQ9P1F3 81 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 AK3Q9UIJ7 227 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 NOTOA8MTQ0 251 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 RAB27BO00194 218 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 FBXO24O75426 580 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 IGKV1D-33P01593 117 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 IGKV1-33P01594 117 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM11P17152 192 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 VEGFCP49767 419 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 GNMTQ14749 295 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 HES5Q5TA89 166 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 ODF3L1Q8IXM7 274 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 PRR18Q8N4B5 295 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 OR8H1Q8NGG4 311 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 OR10V1Q8NGI7 309 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 OR2T10Q8NGZ9 312 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 PECRQ9BY49 303 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 GHITMQ9H3K2 345 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 Q9N2K0 584 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 SSR3Q9UNL2 185 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 SERPINE3A8MV23 424 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 MFNGO00587 321 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM127O75204 238 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 TNFAIP8O95379 198 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 TSPAN15O95858 294 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 MOSP00540 346 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 IGHG2P01859 326 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 GADD45AP24522 165 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 REG1BP48304 166 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 SCAND1P57086 179 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 HLA-DRB3P79483 266 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 PLA2G7Q13093 441 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 LSAMPQ13449 338 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 ARL6IP1Q15041 203 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM95Q3KNT9 176 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 MOB3BQ86TA1 216 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 NDUFA11Q86Y39 141 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 C1QL4Q86Z23 238 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 OR2AK2Q8NG84 335 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 OR52L2PQ8NGH6 319 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 OR10R2Q8NGX6 335 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 RAB3CQ96E17 227 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 KCTD7Q96MP8 289 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 AGMATQ9BSE5 352 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 TOLLIPQ9H0E2 274 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 PLSCR3Q9NRY6 295 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
LINC00963-204ENST00000427778 SLC23A1Q9UHI7 598 aa7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms