RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582821.5

GGA3-215, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-215	ENST00000582821	HTD2	P86397	168 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	UBALD1	Q8TB05	177 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	RAB22A	Q9UL26	194 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	STUB1	Q9UNE7	303 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821		M0QZK8	103 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	SOCS1	O15524	211 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	RAB3B	P20337	219 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	EBI3	Q14213	229 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	HERPUD1	Q15011	391 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	HMGN3	Q15651	99 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	MORN2	Q502X0	79 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	C22orf42	Q6IC83	251 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	TPRA1	Q86W33	373 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	GNG12	Q9UBI6	72 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821		M0QZ24	198 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	HSD17B6	O14756	317 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	YPEL1	O60688	119 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	AMY1A	P04745	511 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	AMY2A	P04746	511 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	IL3RA	P26951	378 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	VEGFC	P49767	419 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	OR10A3	P58181	314 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	FBLN7	Q53RD9	439 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	HES5	Q5TA89	166 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	TREML4	Q6UXN2	200 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821		Q6ZS46	218 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821		Q6ZTK2	550 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	DRAM1	Q8N682	238 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	PTX4	Q96A99	478 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	GALM	Q96C23	342 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	YPEL2	Q96QA6	119 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	JPT1	Q9UK76	154 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	SSR3	Q9UNL2	185 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	SLC31A2	O15432	143 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	TXNL1	O43396	289 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	RAB6A	P20340	208 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	CD1B	P29016	333 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821		Q6ZPA2	131 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	PRR18	Q8N4B5	295 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	OR56B4	Q8NH76	319 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	PECR	Q9BY49	303 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	NOTO	A8MTQ0	251 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	LANCL1	O43813	399 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	RGS11	O94810	467 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	LPL	P06858	475 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	PLA2G7	Q13093	441 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	MOB3B	Q86TA1	216 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	AK3	Q9UIJ7	227 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	RAB27B	O00194	218 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	ITGB1BP1	O14713	200 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	FGF16	O43320	207 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	IGKV1D-33	P01593	117 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	IGKV1-33	P01594	117 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821		Q8N6K4	173 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	KCTD7	Q96MP8	289 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	OR51E2	Q9H255	320 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821		Q9N2K0	584 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	CD36	P16671	472 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	TMEM11	P17152	192 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63

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