RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 CASP6P55212 293 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM33P57088 247 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 DEFA5Q01523 94 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 ESCO2Q56NI9 601 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 ACP7Q6ZNF0 438 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 C11orf53Q8IXP5 236 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 OR13A1Q8NGR1 328 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 MSRB2Q9Y3D2 182 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 DBX1A6NMT0 343 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 C12orf77C9JDV5 145 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 BCL2L11O43521 198 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 NMBP08949 121 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 PET100P0DJ07 73 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 PTAFRP25105 342 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 TMPRSS3P57727 454 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 DHODHQ02127 395 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 TOR2AQ5JU69 321 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 Q8IYB0 196 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 PIK3IP1Q96FE7 263 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 SFXN3Q9BWM7 321 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 NMES1Q9C002 83 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 SDHAF2Q9NX18 166 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 ANAPC10Q9UM13 185 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 LYNX1G3V0Z9 82 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 ST8SIA3O43173 380 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 LYNX1P0DP58 116 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 IRF2P14316 349 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 MPZP25189 248 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 TIMP3P35625 211 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 GNG10P50151 68 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 CEBPGP53567 150 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF616Q08AN1 781 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 PRSS54Q6PEW0 395 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 ERGIC1Q969X5 290 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 DECR2Q9NUI1 292 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 CA11O75493 328 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 NHLRC3Q5JS37 347 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 PCSK4Q6UW60 755 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 LDLRAD3Q86YD5 345 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 CD177Q8N6Q3 437 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 POC1AQ8NBT0 407 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 FBXL17Q9UF56 701 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 WIPI2Q9Y4P8 454 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 DPRXA6NFQ7 191 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 TPT1P13693 172 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 GLRXP35754 106 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 ECI1P42126 302 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 BAP18Q8IXM2 172 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM171Q8WVE6 324 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 SUCNR1Q9BXA5 334 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 NARFLQ9H6Q4 476 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 SVEP1Q4LDE5 3571 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 C1QL1O75973 258 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 CTXN2P0C2S0 81 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 Q3ZCU0 254 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 CLLU1Q5K131 121 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 F12P00748 615 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 IL13RA2Q14627 380 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 FAM76BQ5HYJ3 339 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 GCSAMQ8N6F7 178 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 FAM216BQ8N7L0 139 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 HINT2Q9BX68 163 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 CHST1O43916 411 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 LY6HO94772 140 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 PLAUP00749 431 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 AANATQ16613 207 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 SWI5Q1ZZU3 235 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 OR4A4PQ8NGN8 299 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 OR1S2Q8NGQ3 325 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 MEGF10Q96KG7 1140 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM222Q9H0R3 208 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 TREM1Q9NP99 234 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 CACNG5Q9UF02 275 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 PCDHB10Q9UN67 800 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 SESN1Q9Y6P5 492 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 MED6O75586 246 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 IGLV1-44P01699 117 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 TNFSF4P23510 183 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 F2RP25116 425 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 CCKARP32238 428 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRK-216ENST00000524481 G6PCP35575 357 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.8 ms