RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP0.85□□□□□ -2.27
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAS2R13Q9NYV9 303 aa0.85□□□□□ -2.27
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C10orf105Q8TEF2 133 aa0.83□□□□□ -2.28
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AKR1C4P17516 323 aa0.82□□□□□ -2.28
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSPAN5P62079 268 aa0.81□□□□□ -2.28
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MGLLQ99685 303 aa0.81□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYSTM1Q9H1C7 97 aa0.81□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GTSF1LQ9H1H1 148 aa0.81□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP0.81□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP0.81□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FIS1Q9Y3D6 152 aa0.81□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SCN9AQ15858 1988 aa0.81□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A8MUN3 132 aa0.8□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ESDP10768 282 aa0.8□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSPEAR-AS2P59090 65 aa0.8□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAPK14Q16539 360 aa0.8□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa0.8□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR2Y1Q8NGV0 311 aa0.8□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MND1Q9BWT6 205 aa0.8□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 XKR8Q9H6D3 395 aa0.8□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IFT46Q9NQC8 304 aa0.8□□□□□ -2.28
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