RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 ANGPTL7O43827 346 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 ISG15P05161 165 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 CD2P06729 351 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 MSMBP08118 114 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 RAB3AP20336 220 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 BCL3P20749 454 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 PRKACBP22694 351 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 RBP2P50120 134 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRK-209ENST00000415046 TAS2R43P59537 309 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRK-209ENST00000415046 RPS25P62851 125 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 GNB2P62879 340 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 INSL4Q14641 139 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 SPHARQ15513 63 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF181Q2M3W8 571 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 SMIM21Q3B7S5 101 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 C2orf76Q3KRA6 126 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF404Q494X3 552 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 CCDC58Q4VC31 144 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 TMEM155Q4W5P6 130 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 LIPKQ5VXJ0 399 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 RAB12Q6IQ22 244 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 SLC25A26Q70HW3 274 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF573Q86YE8 665 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 LYG1Q8N1E2 194 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 CCDC54Q8NEL0 328 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 TMEM185AQ8NFB2 350 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 OR8B3Q8NGG8 313 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 OR5A2Q8NGI9 324 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 OR51A2Q8NGJ7 313 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF671Q8TAW3 534 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 GPR148Q8TDV2 347 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 PP6455Q8WZ26 134 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 GHSRQ92847 366 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 TMEM106AQ96A25 262 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 TMEM186Q96B77 213 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 TMIGD2Q96BF3 282 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 FAHD2AQ96GK7 314 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 MS4A10Q96PG2 267 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 OR8B2Q96RD0 313 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 CDCA4Q9BXL8 241 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 FAM192AQ9GZU8 254 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 TLNRD1Q9H1K6 362 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 OR51I2Q9H344 312 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 DUSP21Q9H596 190 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 CTSZQ9UBR2 303 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 CLN8Q9UBY8 286 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 MIOXQ9UGB7 285 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 OR5V1Q9UGF6 321 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 PLXNB1O43157 2135 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 LOC105371242A0A075B767 164 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 A0A087X002 238 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 OR2AT4A6NND4 320 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF879B4DU55 563 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 F8VVB4 439 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 F8VWA3 439 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 SIRPB1O00241 398 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 GABRPO00591 440 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 MAGEB3O15480 346 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 DENRO43583 198 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 FOXH1O75593 365 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 CDRT1O95170 752 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 CYB5AP00167 134 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 TSHBP01222 138 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 LHBP01229 141 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 MAS1P04201 325 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 WNT2P09544 360 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 PGA5P0DJD9 388 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 PSG2P11465 335 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 PRKACAP17612 351 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 ADRA2CP18825 462 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 HNF1AP20823 631 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 PSMB9P28065 219 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 SRP14P37108 136 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 TGFBR2P37173 567 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 OR3A4PP47883 348 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 NPBWR2P48146 333 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 PPP3R1P63098 170 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 CBX3Q13185 183 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 KCNJ8Q15842 424 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 NEDD8Q15843 81 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 MICBQ29980 383 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 Q499Y3 187 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-209ENST00000415046 FAM120AOSQ5T036 256 aa3.55□□□□□ -1.84
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