RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 CCL7P80098 99 aa16.2■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 OR4X1Q8NH49 305 aa16.2■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 TXNDC17Q9BRA2 123 aa16.2■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 AP5S1Q9NUS5 200 aa16.2■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 LOXL2Q9Y4K0 774 aa16.2■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 VSTM2AQ8TAG5 236 aa16.2■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 PIPOXQ9P0Z9 390 aa16.2■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 HLA-DQA1P01909 254 aa16.2■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 ASAH2BP0C7U1 165 aa16.2■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 SRD5A2P31213 254 aa16.2■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC25A33Q9BSK2 321 aa16.2■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM38BQ9NVV0 291 aa16.2■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 LINC01565O15544 149 aa16.2■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 HERVK_113P61574 105 aa16.2■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 C10orf113Q5VZT2 155 aa16.2■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 FOXJ2Q9P0K8 574 aa16.2■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 PRRG2O14669 202 aa16.19■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 CDIPTO14735 213 aa16.19■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 FUT5Q11128 374 aa16.19■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 DMRTA1Q5VZB9 504 aa16.19■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC25A34Q6PIV7 304 aa16.19■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa16.19■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 CA11O75493 328 aa16.19■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 RBM11P57052 281 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 STXBP6Q8NFX7 210 aa16.19■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 DTX4Q9Y2E6 619 aa16.19■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 C3orf80F5H4A9 247 aa16.19■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 ROM1Q03395 351 aa16.19■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 ABHD14BQ96IU4 210 aa16.19■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 hADV38S2A0JD32 116 aa16.19■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 OR4C46A6NHA9 309 aa16.19■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 CSRP3P50461 194 aa16.19■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 HES3Q5TGS1 186 aa16.19■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM52Q8NDY8 209 aa16.19■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 OR5A2Q8NGI9 324 aa16.19■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 RPEQ96AT9 228 aa16.19■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 MFRPQ9BY79 579 aa16.19■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa16.19■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 J3QT63 122 aa16.18■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 CTAG1AP78358 180 aa16.18■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP16.18■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 CKAP5Q14008 2032 aa16.18■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa16.18■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 GLULP15104 373 aa16.18■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 EFNB1P98172 346 aa16.18■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 CXXC4Q9H2H0 198 aa16.18■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 RELBQ01201 579 aa16.18■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 H0Y980 276 aa16.18■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 WNT5AP41221 380 aa16.18■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 RNF122Q9H9V4 155 aa16.18■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa16.18■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 PRNDQ9UKY0 176 aa16.18■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 GZMHP20718 246 aa16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 PRSS53Q2L4Q9 553 aa16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 C9orf50Q5SZB4 431 aa16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 C19orf48Q6RUI8 117 aa16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 PERPQ96FX8 193 aa16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 OR2H1Q9GZK4 316 aa16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 ATG2BQ96BY7 2078 aa16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 TNFSF14O43557 240 aa16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 IGKV1D-16P01601 117 aa16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 DOLPP1Q86YN1 238 aa16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 PXMP4Q9Y6I8 212 aa16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 LTBP4Q8N2S1 1624 aa16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 PARLQ9H300 379 aa16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 CLEC5AQ9NY25 188 aa16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 GRIFINA4D1Z8 144 aa16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 A8MWL6 223 aa16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 M0R296 226 aa16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 LEPROTL1O95214 131 aa16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 ORM1P02763 201 aa16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 POC1AQ8NBT0 407 aa16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 OR52M1Q8NGK5 317 aa16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 PLA2G3Q9NZ20 509 aa16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa16.17■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 NPVFQ9HCQ7 196 aa16.16■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 SPTBP11277 2137 aa16.16■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 K7ESF4 209 aa16.16■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 ACP1P24666 158 aa16.16■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 MUC15Q8N387 334 aa16.16■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 MYOZ3Q8TDC0 251 aa16.16■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa16.16■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 DXOO77932 396 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 RPL30P62888 115 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 TNXAQ16473 311 aa16.16■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 COL24A1Q17RW2 1714 aa16.16■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF708P17019 499 aa16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.4 ms