RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PDE4A-201ENST00000293683 IGKV1-5P01602 117 aa14.71□□□□□ -0.05
PDE4A-201ENST00000293683 FABP4P15090 132 aa14.71□□□□□ -0.05
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PDE4A-201ENST00000293683 ELLP55199 621 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PDE4A-201ENST00000293683 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.71□□□□□ -0.05
PDE4A-201ENST00000293683 BEND4Q6ZU67 534 aa14.71□□□□□ -0.05
PDE4A-201ENST00000293683 SAXO1Q8IYX7 474 aa14.71□□□□□ -0.05
PDE4A-201ENST00000293683 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PDE4A-201ENST00000293683 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa14.71□□□□□ -0.05
PDE4A-201ENST00000293683 HIPK2Q9H2X6 1198 aa14.71□□□□□ -0.05
PDE4A-201ENST00000293683 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa14.71□□□□□ -0.05
PDE4A-201ENST00000293683 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PDE4A-201ENST00000293683 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa14.71□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 A0A1B0GU03 582 aa14.71□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 CTXN2P0C2S0 81 aa14.71□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF525Q8N782 197 aa14.71□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 HES7Q9BYE0 225 aa14.71□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 CD300LBA8K4G0 201 aa14.7□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 CD55P08174 381 aa14.7□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 C1orf87Q8N0U7 546 aa14.7□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 SNX22Q96L94 193 aa14.7□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 RAB40CQ96S21 281 aa14.7□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 NBEAQ8NFP9 2946 aa14.7□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 SYNGR2O43760 224 aa14.7□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 PGA5P0DJD9 388 aa14.7□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 SCGB1C1Q8TD33 95 aa14.7□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 POM121Q96HA1 1249 aa14.7□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 PLK3Q9H4B4 646 aa14.7□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 DLL3Q9NYJ7 618 aa14.7□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 PSENENQ9NZ42 101 aa14.7□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 LRFN1Q9P244 771 aa14.7□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 CEBPZOSA8MTT3 80 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 CYB561P49447 251 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 GAMTQ14353 236 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 PMS2CLQ68D20 193 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 OR10G4Q8NGN3 311 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM45BQ96B21 275 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 RBKSQ9H477 322 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 TESK1Q15569 626 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 SPATA46Q5T0L3 261 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 VASH2Q86V25 355 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 OR10V1Q8NGI7 309 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 OR5P3Q8WZ94 311 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 SDF2L1Q9HCN8 221 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 SIT1Q9Y3P8 196 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 CLDN34H7C241 214 aa14.68□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 PHOX2AO14813 284 aa14.68□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 GATCO43716 136 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 SPANXN5Q5MJ07 72 aa14.68□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 FAM58AQ8N1B3 248 aa14.68□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 OR5A2Q8NGI9 324 aa14.68□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 KCNS2Q9ULS6 477 aa14.68□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 OR5H1A6NKK0 313 aa14.68□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 WDR1O75083 606 aa14.68□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 S100GP29377 79 aa14.68□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 MDH2P40926 338 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 C3AR1Q16581 482 aa14.68□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF585BQ52M93 769 aa14.68□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 LILRB2Q8N423 598 aa14.68□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 A0A1W2PR80 420 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 B4DEV8 164 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 IGKV1D-33P01593 117 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 IGKV1-33P01594 117 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 CA6P23280 308 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 WNT5AP41221 380 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 LHX2P50458 406 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 RND2P52198 227 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF600Q6ZNG1 722 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 OR13D1Q8NGV5 346 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 POM121L2Q96KW2 1035 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 OR4C12Q96R67 309 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 FAM166BA8MTA8 275 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 SIRPB1O00241 398 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 NRN1LQ496H8 165 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 NECAP1Q8NC96 275 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 MBD3L1Q8WWY6 194 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 S100PBPQ96BU1 408 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 CABLES2Q9BTV7 478 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 GTF3C1Q12789 2109 aa14.66□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa14.66□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 DEFA6Q01524 100 aa14.66□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms