RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	F2R	P25116	425 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	CCL11	P51671	97 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	RND3	P61587	244 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	NKX2-8	O15522	239 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	SERPINE2	P07093	398 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	DYNLT3	P51808	116 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	HLA-DRB3	P79483	266 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	RUNX1	Q01196	453 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152		J3QT63	122 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	OR2H2	O95918	312 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	CRYBA1	P05813	215 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	DAO	P14920	347 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	MEOX2	P50222	304 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1CB	P62140	327 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF154	Q13106	437 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF266	Q14584	549 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	LOXL4	Q96JB6	756 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152		M0R036	132 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	OR13C7	P0DN81	318 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	IGHV1-2	P23083	117 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	SOX8	P57073	446 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	TRIB1	Q96RU8	372 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	CLCC1	Q96S66	551 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	CDH20	Q9HBT6	801 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	GP6	Q9HCN6	339 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152		H0Y980	276 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152		H0YL77	283 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	SMPD2	O60906	423 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	WDR1	O75083	606 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	NXPH2	O95156	264 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152		Q6P435	159 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	ISOC2	Q96AB3	205 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	RARRES2	Q99969	163 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	S100G	P29377	79 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	CCL20	P78556	96 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	ID3	Q02535	119 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	LINC00596	Q86U02	117 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	C14orf79	Q96F83	325 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	PKIB	Q9C010	78 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	KPTN	Q9Y664	436 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	AGFG2	O95081	481 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	TNFSF10	P50591	281 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	CEBPG	P53567	150 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	AWAT1	Q58HT5	328 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	GPR146	Q96CH1	333 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152		K7N7A8	449 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	PITX3	O75364	302 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	RAB5C	P51148	216 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152		Q6ZRM9	215 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	TINAG	Q9UJW2	476 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	FZR1	Q9UM11	496 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	UMAD1	C9J7I0	102 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	TFF1	P04155	84 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	TGFBR3	Q03167	851 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	PSG7	Q13046	419 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		11.09	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms