RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 TMEM11P17152 192 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 MAP2K4P45985 399 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 ZNF134P52741 427 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 RPS25P62851 125 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 SLC35A2P78381 396 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 CD83Q01151 205 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 MADCAM1Q13477 382 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 GPR50Q13585 617 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 GPR176Q14439 515 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 GNMTQ14749 295 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 SPHARQ15513 63 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 LIPKQ5VXJ0 399 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 C16orf82Q7Z2V1 217 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 CEACAM19Q7Z692 300 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 MOB3BQ86TA1 216 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 OR10X1Q8NGY0 326 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 MYDGFQ969H8 173 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 CREB3L1Q96BA8 519 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 GFI1Q99684 422 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 NICN1Q9BSH3 213 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 CCRL2O00421 344 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 ORC5O43913 435 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 SC5DO75845 299 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 HBZP02008 142 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 FAM106CPP0CH98 169 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 HSMCR30P0CW71 290 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 GZMHP20718 246 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 MYF6P23409 242 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 ARHGDIBP52566 201 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 TMEM91Q6ZNR0 172 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 Q6ZPA2 131 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 C18orf65Q6ZTR6 163 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 ZNF329Q86UD4 541 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 C5orf56Q8N8D9 126 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 ZNF439Q8NDP4 499 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 OR10A7Q8NGE5 316 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 OR52L2PQ8NGH6 319 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 AKR1E2Q96JD6 320 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 SULT4A1Q9BR01 284 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 CCDC90BQ9GZT6 254 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 SCN3BQ9NY72 215 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 MOB4Q9Y3A3 225 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 A0A0A6YYD4 124 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 H0YHG0 523 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 PDCD6O75340 191 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 SRMP19623 302 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 FUT3P21217 361 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 HTR2CP28335 458 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 RAB7AP51149 207 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 UNC119Q13432 240 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 CT45A1Q5HYN5 189 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 RNLSQ5VYX0 342 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 IZUMO2Q6UXV1 221 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 C6orf201Q7Z4U5 140 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 THNSL2Q86YJ6 484 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 CDH26Q8IXH8 852 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 DTX3Q8N9I9 347 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 CT45A3Q8NHU0 189 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 FAAP24Q9BTP7 215 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 DUSP21Q9H596 190 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 TAF9BQ9HBM6 251 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 GNG12Q9UBI6 72 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 H3BUI4 141 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 RGS10O43665 173 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 UCHL1P09936 223 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 CRHBPP24387 322 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 CHATP28329 748 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 P2RY14Q15391 338 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 HSD17B12Q53GQ0 312 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 C1orf100Q5SVJ3 147 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 GLT8D1Q68CQ7 371 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 OR8H3Q8N146 312 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 GAPTQ8N292 157 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 MS4A15Q8N5U1 240 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 LINC00311Q8N616 119 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 OR52M1Q8NGK5 317 aa8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.8 ms