RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436289.6

NELFE-204, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-204ENST00000436289 DHFR2Q86XF0 187 aa11.43□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 LAX1Q8IWV1 398 aa11.43□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 PRSS35Q8N3Z0 413 aa11.43□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 PXT1Q8NFP0 134 aa11.43□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 NPBQ8NG41 125 aa11.43□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 OR9G4Q8NGQ1 327 aa11.43□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 OR2K2Q8NGT1 345 aa11.43□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 MYRFQ9Y2G1 1151 aa11.43□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 KIAA1109Q2LD37 5005 aa11.42□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa11.42□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 C15orf65H3BRN8 121 aa11.42□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 SOX15O60248 233 aa11.42□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 TPPPO94811 219 aa11.42□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 RPSAP08865 295 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 FSTP19883 344 aa11.42□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 CRISP1P54107 249 aa11.42□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 ECSCRQ19T08 205 aa11.42□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 AKIRIN2Q53H80 203 aa11.42□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 AADACL4Q5VUY2 407 aa11.42□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 GID4Q8IVV7 300 aa11.42□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 ARHGAP24Q8N264 748 aa11.42□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa11.42□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 IFT22Q9H7X7 185 aa11.42□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 FAM53CQ9NYF3 392 aa11.42□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 DHDHQ9UQ10 334 aa11.42□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa11.42□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 CXorf65A6NEN9 183 aa11.41□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 PRKYO43930 277 aa11.41□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 FAM107AO95990 144 aa11.41□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 IGHV3-11P01762 117 aa11.41□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 KISS1Q15726 138 aa11.41□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 SSX6Q7RTT6 188 aa11.41□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 FAM220AQ7Z4H9 259 aa11.41□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa11.41□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 DEFB107AQ8IZN7 70 aa11.41□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 NABP2Q9BQ15 211 aa11.41□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 SLC2A8Q9NY64 477 aa11.41□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 ETAA1Q9NY74 926 aa11.41□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 TRAV39A0A0B4J263 110 aa11.4□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 A0A0G2JLM5 398 aa11.4□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 SPINT2O43291 252 aa11.4□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 BRI3O95415 125 aa11.4□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 TPPP2P59282 170 aa11.4□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 EFNB1P98172 346 aa11.4□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 ACTBL2Q562R1 376 aa11.4□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 ZNF439Q8NDP4 499 aa11.4□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 OR5D14Q8NGL3 314 aa11.4□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 OR13C9Q8NGT0 318 aa11.4□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 GNG12Q9UBI6 72 aa11.4□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 KMT2AQ03164 3969 aa11.39□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 NDUFA3O95167 84 aa11.39□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 TFAP2AP05549 437 aa11.39□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 ZNF134P52741 427 aa11.39□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 CX3CL1P78423 397 aa11.39□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 CT45A1Q5HYN5 189 aa11.39□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 LGALS9CQ6DKI2 356 aa11.39□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 FDX2Q6P4F2 183 aa11.39□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 IL34Q6ZMJ4 242 aa11.39□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa11.39□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 SUMF2Q8NBJ7 301 aa11.39□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 OR2G2Q8NGZ5 317 aa11.39□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 CT45A3Q8NHU0 189 aa11.39□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 TMEM163Q8TC26 289 aa11.39□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 TBX5Q99593 518 aa11.39□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa11.38□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 ATP6V1E1P36543 226 aa11.38□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 CCR9P51686 369 aa11.38□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 CD81P60033 236 aa11.38□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 ZNF691Q5VV52 312 aa11.38□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 LINC00596Q86U02 117 aa11.38□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 SERPINA12Q8IW75 414 aa11.38□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 STX19Q8N4C7 294 aa11.38□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 TCEANCQ8N8B7 351 aa11.38□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 OR13C3Q8NGS6 347 aa11.38□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 NEURL2Q9BR09 285 aa11.38□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 PLEKHA3Q9HB20 300 aa11.38□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 TAGLN3Q9UI15 199 aa11.38□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 GNG8Q9UK08 70 aa11.38□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa11.37□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 H3BUA1 57 aa11.37□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 SLC31A2O15432 143 aa11.37□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 AIREO43918 545 aa11.37□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 NDUFB8O95169 186 aa11.37□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 MT-ND4P03905 459 aa11.37□□□□□ -0.59
NELFE-204ENST00000436289 TRGV3P03979 118 aa11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.2 ms