RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	IGSF23	A1L1A6	192 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	CDS2	O95674	445 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	SEC11B	P0C7V7	166 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	PCSK4	Q6UW60	755 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM56	Q96MV1	263 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	LUZP4	Q9P127	313 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	SIRPB1	O00241	398 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	LYZL6	O75951	148 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	SRPX	P78539	464 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152		Q6ZS49	121 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	ZFP82	Q8N141	532 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	GINS3	Q9BRX5	216 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	ARV1	Q9H2C2	271 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	RNF122	Q9H9V4	155 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	CACNA1D	Q01668	2161 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	DEGS1	O15121	323 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	TUSC2	O75896	110 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	WISP2	O76076	250 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	VAMP2	P63027	116 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	LILRB2	Q8N423	598 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	FAM157A	C9JC47	383 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152		H3BP45	60 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM50A	O95807	157 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	SNCA	P37840	140 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	GUK1	Q16774	197 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	OR5B21	A6NL26	309 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	S100A12	P80511	92 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	POM121	Q96HA1	1249 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	SPIN2A	Q99865	258 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	OR51I2	Q9H344	312 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	PLK3	Q9H4B4	646 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	COA4	Q9NYJ1	87 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	GTF3C1	Q12789	2109 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152		A0A0G2JRQ6	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	PROB1	E7EW31	1015 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	WRB	O00258	174 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	CDIPT	O14735	213 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	GPR37	O15354	613 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	VDAC1	P21796	283 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	WDR86	Q86TI4	376 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	OPA3	Q9H6K4	179 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	HSPA12A	O43301	675 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	CHST1	O43916	411 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	CTXN2	P0C2S0	81 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	PSG2	P11465	335 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	UCP1	P25874	307 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	ATP6V0C	P27449	155 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	IL24	Q13007	206 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	PEA15	Q15121	130 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	NMS	Q5H8A3	153 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	IP6K3	Q96PC2	410 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	GLRX2	Q9NS18	164 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-222	ENST00000635152	GRP	P07492	148 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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