RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PTPRTO14522 1441 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM250H0YL14 139 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 K7EPK0 472 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ISLRO14498 428 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TCRBP04435 133 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IFNA16P05015 189 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IL6P05231 212 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATP5G1P05496 136 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MIPP30301 263 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EVI2BP34910 448 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MPIP34949 423 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP1R2P41236 205 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CXCR4P61073 352 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC35A2P78381 396 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HPCAP84074 193 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLVS2Q5SYC1 327 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM215Q68D42 235 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LAIR2Q6ISS4 152 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GID4Q8IVV7 300 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPR32P1Q8NGA4 272 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR52N1Q8NH53 320 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC22A13Q9Y226 551 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A1W2PP64 1363 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EVPLLA8MZ36 301 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNK1O00180 336 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR7C2O60412 319 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 REG1AP05451 166 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PFN3P60673 137 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RSU1Q15404 277 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SYPL2Q5VXT5 272 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC51BQ86UW2 128 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR1M1Q8NGA1 313 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR9I1Q8NGQ6 314 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR8S1Q8NH09 359 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MFSD8Q8NHS3 518 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBALD1Q8TB05 177 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FRZBQ92765 325 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMBIM1Q969X1 311 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 REEP6Q96HR9 211 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VCXQ9H320 206 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR51I1Q9H343 314 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DKKL1Q9UK85 242 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CELA1Q9UNI1 258 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 POLR1DQ9Y2S0 133 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 B4DEV8 164 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MED6O75586 246 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NRASP01111 189 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HRASP01112 189 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRASP01116 189 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR5AC1P0C628 307 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CTSEP14091 401 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NTF3P20783 257 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HSD11B1P28845 292 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCR7P32248 378 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 REG1BP48304 166 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GABARAPL2P60520 117 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DAD1P61803 113 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDK2Q15119 407 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR10K2Q6IF99 312 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NATD1Q8N6N6 113 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC35G3Q8N808 338 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C16orf78Q8WTQ4 265 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OPTNQ96CV9 577 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OTUB2Q96DC9 234 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR52B2Q96RD2 323 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC2A9Q9NRM0 540 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBQLN4Q9NRR5 601 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RFNGQ9Y644 331 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATRNO75882 1429 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZFYVE9O95405 1425 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARGFXA6NJG6 315 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IL3P08700 152 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FBP1P09467 338 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR4A8P0C604 315 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF708P17019 499 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ORM2P19652 201 aa3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.9 ms