RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 IFT22Q9H7X7 185 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 A0A1W2PPI3 338 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 C15orf65H3BRN8 121 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 SLC31A2O15432 143 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 PEX14O75381 377 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 GTF2F2P13984 249 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 BRS3P32247 399 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 REG1BP48304 166 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 TAS2R43P59537 309 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 HNF4GQ14541 408 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 C9orf152Q5JTZ5 239 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 SIGIRRQ6IA17 410 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 OR10K2Q6IF99 312 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 C11orf88Q6PI97 169 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 DRAM1Q8N682 238 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 ARL11Q969Q4 196 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 RPEQ96AT9 228 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 TMED9Q9BVK6 235 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 DCLRE1BQ9H816 532 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 CKLFQ9UBR5 152 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 UBE2QL1A1L167 161 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 ERICH4A6NGS2 130 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 AIPO00170 330 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 OR2F2O95006 317 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 MT-ND4P03905 459 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 MGMTP16455 207 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 CEACAM3P40198 252 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 KCNJ3P48549 501 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 LOXL3P58215 753 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 PAX5Q02548 391 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 MPV17LQ2QL34 196 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 ACSM3Q53FZ2 586 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 RAB12Q6IQ22 244 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 ZNF497Q6ZNH5 498 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 OR5AU1Q8NGC0 362 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 OR10V1Q8NGI7 309 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 SELENOIQ9C0D9 397 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 VCXQ9H320 206 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 LIN7BQ9HAP6 207 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 ERGIC3Q9Y282 383 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 NOTCH1P46531 2555 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 FAM90A18PA6NE21 464 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 FAM90A16PA6NEW6 464 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 FAM90A12PA8MX19 464 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 C12orf77C9JDV5 145 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 IGKV1D-33P01593 117 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 IGKV1-33P01594 117 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 OPN1MWP04001 364 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 CD1AP06126 327 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 FAM90A15PP0C7V4 464 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 FAM90A13PP0C7W8 464 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 FAM90A14PP0C7W9 464 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 FAM90A24PP0C7X0 464 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 MNDAP41218 407 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 HES1Q14469 280 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 IRF3Q14653 427 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 MED22Q15528 200 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 LINC00596Q86U02 117 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 LRRTM1Q86UE6 522 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 PRR18Q8N4B5 295 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 OR1L1Q8NH94 360 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 TMEM203Q969S6 136 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 R3HDM4Q96D70 268 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 Q96M66 194 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 MND1Q9BWT6 205 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 ETAA1Q9NY74 926 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 LINC00527Q9UJ94 153 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 PEX16Q9Y5Y5 336 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 LINC01548A6NM66 108 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 OOSP1A8MZH6 123 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 MCRIP1C9JLW8 97 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 HSD17B6O14756 317 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 MPIG6BO95866 241 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 VSIG8P0DPA2 414 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.2 ms