RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486829.1

ARHGEF3-211, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 428 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-211ENST00000486829 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.92e-11■■■■□ 21.5
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ARHGEF3-211ENST00000486829 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
ARHGEF3-211ENST00000486829 CR1LQ2VPA4 569 aa9.43□□□□□ -0.9
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ARHGEF3-211ENST00000486829 DCAF12L2Q5VW00 463 aa9.43□□□□□ -0.9
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ARHGEF3-211ENST00000486829 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
ARHGEF3-211ENST00000486829 ING3Q9NXR8 418 aa9.43□□□□□ -0.9
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ARHGEF3-211ENST00000486829 KIR2DS4P43632 304 aa9.42□□□□□ -0.9
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ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF273Q14593 569 aa9.42□□□□□ -0.9
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ARHGEF3-211ENST00000486829 Q6ZS49 121 aa9.42□□□□□ -0.9
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ARHGEF3-211ENST00000486829 LINC00574Q9H8X3 128 aa9.42□□□□□ -0.9
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ARHGEF3-211ENST00000486829 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa9.41□□□□□ -0.9
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ARHGEF3-211ENST00000486829 C17orf98A8MV24 154 aa9.41□□□□□ -0.9
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ARHGEF3-211ENST00000486829 MRGPRDQ8TDS7 321 aa9.41□□□□□ -0.9
ARHGEF3-211ENST00000486829 CCDC107Q8WV48 283 aa9.41□□□□□ -0.9
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ARHGEF3-211ENST00000486829 CTDSPLO15194 276 aa9.4□□□□□ -0.9
ARHGEF3-211ENST00000486829 TOX4O94842 621 aa9.4□□□□□ -0.9
ARHGEF3-211ENST00000486829 CGB3P0DN86 165 aa9.4□□□□□ -0.9
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ARHGEF3-211ENST00000486829 SETD6Q8TBK2 473 aa9.4□□□□□ -0.9
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ARHGEF3-211ENST00000486829 FAHD2AQ96GK7 314 aa9.4□□□□□ -0.9
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ARHGEF3-211ENST00000486829 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
ARHGEF3-211ENST00000486829 SIRPDQ9H106 197 aa9.4□□□□□ -0.9
ARHGEF3-211ENST00000486829 C7orf69Q9H7B7 122 aa9.4□□□□□ -0.9
ARHGEF3-211ENST00000486829 TAF9BQ9HBM6 251 aa9.4□□□□□ -0.9
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF286AQ9HBT8 521 aa9.4□□□□□ -0.9
ARHGEF3-211ENST00000486829 TMEM160Q9NX00 188 aa9.4□□□□□ -0.9
ARHGEF3-211ENST00000486829 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.4□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 HIVEP2P31629 2446 aa9.39□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 TRDCB7Z8K6 153 aa9.39□□□□□ -0.91
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