RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-211ENST00000467464 MNDAP41218 407 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 LOXL3P58215 753 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 ST3GAL4Q11206 333 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 MADCAM1Q13477 382 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 EBI3Q14213 229 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 RCN1Q15293 331 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 SLC22A6Q4U2R8 563 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 OR8H3Q8N146 312 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 GAPTQ8N292 157 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 DHRSXQ8N5I4 330 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 LINC00311Q8N616 119 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF439Q8NDP4 499 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 SETD9Q8NE22 299 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 UBALD1Q8TB05 177 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 DERL3Q96Q80 235 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 C8orf4Q9NR00 106 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 FKBP14Q9NWM8 211 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 H3BUI4 141 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 HSD17B6O14756 317 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 FGF16O43320 207 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 CSTBP04080 98 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 CD1AP06126 327 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 FAM106CPP0CH98 169 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 GTF2F2P13984 249 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 CAPGP40121 348 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 RAB7AP51149 207 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 GP2P55259 537 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 FOXB2Q5VYV0 432 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 SIGIRRQ6IA17 410 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 ETV3LQ6ZN32 361 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 REC114Q7Z4M0 266 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 Q8N6K4 173 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 C8orf31Q8N9H6 132 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 TMEM104Q8NE00 496 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 OR52M1Q8NGK5 317 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 MUL1Q969V5 352 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 NECAP2Q9NVZ3 263 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 A0A1W2PPK0 400 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 EFCAB10A6NFE3 127 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 C12orf77C9JDV5 145 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 SLC31A2O15432 143 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 ORC5O43913 435 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 SC5DO75845 299 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 IGKV1D-33P01593 117 aa9.46□□□□□ -0.9
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PTPRF-211ENST00000467464 IGLL1P15814 213 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 TMEM11P17152 192 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 GZMHP20718 246 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 TAS2R43P59537 309 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF329Q86UD4 541 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 CDH26Q8IXH8 852 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 IZUMO1Q8IYV9 350 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 OR4X2Q8NGF9 303 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 CCDC107Q8WV48 283 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 ARL11Q969Q4 196 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 GFOD1Q9NXC2 390 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 AIPO00170 330 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 IGHG2P01859 326 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 IGHV3-43DP0DP04 118 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 VHLP40337 213 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 REG1BP48304 166 aa9.45□□□□□ -0.9
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PTPRF-211ENST00000467464 ZNF137PP52743 207 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 WNT4P56705 351 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 MED21Q13503 144 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 HNF4GQ14541 408 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 INSL4Q14641 139 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 ATAD3CQ5T2N8 411 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 C18orf65Q6ZTR6 163 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 AHSA2Q719I0 299 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 JAGN1Q8N5M9 183 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 NANOGP1Q8N7R0 232 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 OR10X1Q8NGY0 326 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-211ENST00000467464 Q96M66 194 aa9.45□□□□□ -0.9
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