RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427487.5

HDLBP-215, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 924 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-215ENST00000427487 A0A1W2PPE2 198 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 A0A1W2PR64 198 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 A0A1W2PRV1 198 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 B4DSR2 109 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 TRDCB7Z8K6 153 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 M0R1W7 72 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 ENSAO43768 121 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 TFF1P04155 84 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 CD74P04233 296 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 GDNFP39905 211 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 TAS2R19P59542 299 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 HLA-DRB3P79483 266 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 HTD2P86397 168 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 DGCR2P98153 550 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 PAX2Q02962 417 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 EDDM3AQ14507 147 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 STEAP3Q658P3 488 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 BTN2A1Q7KYR7 527 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 BEST4Q8NFU0 473 aa9.96□□□□□ -0.82
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HDLBP-215ENST00000427487 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 CABLES2Q9BTV7 478 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 TOLLIPQ9H0E2 274 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 KLK11Q9UBX7 282 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 ANXA10Q9UJ72 324 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 CCDC168Q8NDH2 2452 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 C15orf65H3BRN8 121 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 F2RL2O00254 374 aa9.95□□□□□ -0.82
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HDLBP-215ENST00000427487 ZNF728P0DKX0 622 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 PTHLHP12272 177 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 IL7P13232 177 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 GUCA2AQ02747 115 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 VAX1Q5SQQ9 334 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 TRIQKQ629K1 86 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 TMEM200BQ69YZ2 307 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 HEPN1Q6WQI6 88 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 Q6ZPA2 131 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 TCF23Q7RTU1 214 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 RTN4RL2Q86UN3 420 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 DTX3Q8N9I9 347 aa9.95□□□□□ -0.82
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HDLBP-215ENST00000427487 OR13A1Q8NGR1 328 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 SNAPC3Q92966 411 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 GALMQ96C23 342 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 Q96MF0 132 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 ZNF714Q96N38 554 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 C19orf12Q9NSK7 152 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 KPTNQ9Y664 436 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 NOTCH2Q04721 2471 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 TRAV20A0A0B4J274 112 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 C17orf98A8MV24 154 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 C22orf46C9J442 243 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 ITGB1BP1O14713 200 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 FABP7O15540 132 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 UPK1BO75841 260 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 PPIAL4GP0DN37 164 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 FAUP35544 74 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 GLP1RP43220 463 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 GZMKP49863 264 aa9.94□□□□□ -0.82
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HDLBP-215ENST00000427487 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 MEF2DQ14814 521 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 BAK1Q16611 211 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 OVCH2Q7RTZ1 564 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 LYSMD2Q8IV50 215 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 TOMM5Q8N4H5 51 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 ARRDC1Q8N5I2 433 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 LINC01356Q8N9X3 169 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 OR4K15Q8NH41 348 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 SETD6Q8TBK2 473 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
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HDLBP-215ENST00000427487 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa9.94□□□□□ -0.82
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HDLBP-215ENST00000427487 CALYQ9NYX4 217 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 SLC23A1Q9UHI7 598 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.822e-11■■□□□ 12.9
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HDLBP-215ENST00000427487 A0A1B0GX30 115 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 A0A1W2PQ09 198 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 NAP1L6A6NFF2 107 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 C12orf77C9JDV5 145 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 HBZP02008 142 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 MSMBP08118 114 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 AKAIN1P0CW23 69 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 FPR2P25090 351 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
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