RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267970.8

TSPAN3-201, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN3, Length 6,467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-201ENST00000267970 C10orf113Q5VZT2 155 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 CHAC2Q8WUX2 184 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 SLC17A5Q9NRA2 495 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 PRRX1P54821 245 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 CXXC4Q9H2H0 198 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 MANBALQ9NQG1 85 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF343Q6P1L6 599 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 SGK494Q96LW2 274 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 VSIG10L2P0DP72 767 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 MPLP40238 635 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 P2RY1P47900 373 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 IL24Q13007 206 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 PTX4Q96A99 478 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 TMEM50BP56557 158 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 DCAF12L2Q5VW00 463 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 HSPB9Q9BQS6 159 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 PLAC1Q9HBJ0 212 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 GLRX2Q9NS18 164 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 HMSDA8MTL9 139 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 ANAPC16Q96DE5 110 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 VAX2Q9UIW0 290 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 ATG2BQ96BY7 2078 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 PLA2G10O15496 165 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 KLK13Q9UKR3 277 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 C1QL1O75973 258 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 IL11P20809 199 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 LGALS7P47929 136 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 PRR7Q8TB68 274 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 SLC52A3Q9NQ40 469 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 A0A1B0GV90 55 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 RASL11BQ9BPW5 248 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 CDK2AP1O14519 115 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 SLC35E3Q7Z769 313 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 OR8G5Q8NG78 346 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 PPYP01298 95 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 MYO7AQ13402 2215 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF98A6NK75 572 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 B4E171 279 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 K7EQS6 105 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 PTP4A1Q93096 173 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 OR5AC2Q9NZP5 309 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 SMPD2O60906 423 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 TRGC2P03986 189 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 MDH2P40926 338 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 OR8I2Q8N0Y5 310 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 OR4S2Q8NH73 311 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 IL36RNQ9UBH0 155 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 CXCL2P19875 107 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 SLC25A30Q5SVS4 291 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF600Q6ZNG1 722 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 OVCH2Q7RTZ1 564 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 RPS4Y2Q8TD47 263 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 OPN4Q9UHM6 478 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 H3BTX0 84 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 MMP16P51512 607 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF79Q15937 498 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 VN1R4Q7Z5H5 301 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 DOLPP1Q86YN1 238 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF738Q8NE65 137 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 GPA33Q99795 319 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 ATP6V0CP27449 155 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 KIR2DS2P43631 304 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 NAAAQ02083 359 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 FXYD3Q14802 87 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 ANKRD55Q3KP44 614 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 NUP37Q8NFH4 326 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 TSPAN13O95857 204 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 UBE2V2Q15819 145 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 ERASQ7Z444 233 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 RELBQ01201 579 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 RIGQ13278 110 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 EML2O95834 649 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 SPANXN1Q5VSR9 72 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 GRAMD2BQ96HH9 432 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 TMEM167BQ9NRX6 74 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN3-201ENST00000267970 PIPOXQ9P0Z9 390 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 123.7 ms