RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 NLKQ9UBE8 527 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 OR14J1Q9UGF5 321 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 PPIAL4EA0A075B759 164 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 OOEPA6NGQ2 149 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 PPIAL4DF5H284 164 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 DEGS1O15121 323 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 PPIAL4FP0DN26 164 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 TNFSF8P32971 234 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 EFNB2P52799 333 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 ERVK11-1P61568 191 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 SCN1BQ07699 218 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 PIGYQ3MUY2 71 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 NHLRC3Q5JS37 347 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 NKAPLQ5M9Q1 402 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 GCSAMQ8N6F7 178 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 Q8NFD4 153 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 OR10R2Q8NGX6 335 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 NEK7Q8TDX7 302 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC25A38Q96DW6 304 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 RAB3CQ96E17 227 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 Q96M66 194 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 LPAR5Q9H1C0 372 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 MIXL1Q9H2W2 232 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF665Q9H7R5 613 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 TRAV18A0A075B6X5 111 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 ISPDA4D126 451 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 NKX6-3A6NJ46 265 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM178BH3BS89 294 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 LGALS8O00214 317 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 XRCC3O43542 346 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 HAND1O96004 215 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 LHBP01229 141 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 CDK2P24941 298 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 CD80P33681 288 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 PMELP40967 661 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 GABRA2P47869 451 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF45Q02386 682 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF846Q147U1 533 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 PYHIN1Q6K0P9 492 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 Q6ZTK2 550 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 OR4M1Q8NGD0 313 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 PPP1R35Q8TAP8 253 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 RAB1CQ92928 201 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 NICN1Q9BSH3 213 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 WDR13Q9H1Z4 485 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 HES4Q9HCC6 221 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 WIPI2Q9Y4P8 454 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 RFPL4AA6NLU0 287 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 OR2AT4A6NND4 320 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 MCRIP1C9JLW8 97 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 F8VVB4 439 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 F8VWA3 439 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 GPR37O15354 613 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 PPIHO43447 177 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 FUT3P21217 361 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 COL8A2P25067 703 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 DUSP1P28562 367 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 TAS2R20P59543 309 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 PLA2G7Q13093 441 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 LSAMPQ13449 338 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 ARFRP1Q13795 201 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF146Q15072 292 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 IZUMO1Q8IYV9 350 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 DTX3Q8N9I9 347 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 DEFB108BQ8NET1 73 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 CACNG2Q9Y698 323 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 RAB27BO00194 218 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 SIRPB1O00241 398 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 SOCS1O15524 211 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 NDUFA2O43678 99 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 PDCD6O75340 191 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 TPPPO94811 219 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF205O95201 554 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 PRDX2P32119 198 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 MDH2P40926 338 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 INPP1P49441 399 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM33P57088 247 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 GNG2P59768 71 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 BTG1P62324 171 aa9.5□□□□□ -0.89
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