RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	ERGIC1	Q969X5	290 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF732	B4DXR9	585 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	COX5A	P20674	150 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	AK3	Q9UIJ7	227 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	MEMO1	Q9Y316	297 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A1B0GV50	99 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM157A	C9JC47	383 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	BATF2	Q8N1L9	274 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	LUZP4	Q9P127	313 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	TNFSF13	O75888	250 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	OR2T2	Q6IF00	324 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	BRICD5	Q6PL45	260 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193		J3QW42	95 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	MSTN	O14793	375 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	C1QL1	O75973	258 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	S100A6	P06703	90 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF616	Q08AN1	781 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	PDCD1	Q15116	288 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193		Q8NFD4	153 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	TOMM40L	Q969M1	308 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	SLAMF9	Q96A28	289 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	LIME1	Q9H400	295 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	CDH20	Q9HBT6	801 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	TAAR5	O14804	337 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	SMPD2	O60906	423 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	DIRAS3	O95661	229 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	BCL3	P20749	454 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	OPRM1	P35372	400 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	RAB5B	P61020	215 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	STARD4	Q96DR4	205 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	BOD1	Q96IK1	185 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A1W2PPE3	182 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	DEDD	O75618	318 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	IFNA4	P05014	189 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	HOXC12	P31275	282 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	SMCO1	Q147U7	214 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	MIDN	Q504T8	468 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	DYRK2	Q92630	601 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	PARP11	Q9NR21	331 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	PDCD6	O75340	191 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	TSPAN15	O95858	294 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	CGA	P01215	116 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF44	P15621	663 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	PPP1CB	P62140	327 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	WDR31	Q8NA23	367 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193		A6NLC8	198 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	JTB	O76095	146 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	CA6	P23280	308 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	PTAFR	P25105	342 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	PROCR	Q9UNN8	238 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM221A	A4D161	298 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193		M0R036	132 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	AGFG2	O95081	481 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	IGKV3-15	P01624	115 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GRSF1-208	ENST00000545193	FUT3	P21217	361 aa		13.37	□□□□□ -0.27

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