RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	CCRL2	O00421	344 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	GNGT2	O14610	69 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	SAP30	O75446	220 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2H2	O95918	312 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	OR8U8	P0C7N1	319 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP6V1B2	P21281	511 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	GLP1R	P43220	463 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR12	P47775	334 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	GNG10	P50151	68 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	MTCP1	P56278	107 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	C16orf89	Q6UX73	402 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	MOB3B	Q86TA1	216 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	OR8H3	Q8N146	312 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	CORO2A	Q92828	525 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	LEAP2	Q969E1	77 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A087X0M5	115 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GX30	115 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PPI3	338 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511		J3QR06	171 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	MPZL2	O60487	215 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT8	P05787	483 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	HCK	P08631	526 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	OSM	P13725	252 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	CPE	P16870	476 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC2A5	P22732	501 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	MNAT1	P51948	309 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM65	Q6PI78	240 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF429	Q86V71	674 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	CHST5	Q9GZS9	411 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCG5	Q9H222	651 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	NEK6	Q9HC98	313 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	HMG20A	Q9NP66	347 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	NDE1	Q9NXR1	346 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		8.43	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		8.43	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC182	A6NF36	153 aa		8.43	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	DEGS1	O15121	323 aa		8.43	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	LDLRAD4	O15165	306 aa		8.43	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	8.43	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	CST1	P01037	141 aa		8.43	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	GP9	P14770	177 aa		8.43	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	SPN	P16150	400 aa		8.43	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	CCL1	P22362	96 aa		8.43	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	8.43	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	REG1B	P48304	166 aa		8.43	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	CDK5	Q00535	292 aa		8.43	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF616	Q08AN1	781 aa		8.43	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	FHL3	Q13643	280 aa		8.43	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		8.43	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	GK3P	Q14409	553 aa		8.43	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	UTF1	Q5T230	341 aa		8.43	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	RFT1	Q96AA3	541 aa		8.43	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5B12	Q96R08	314 aa		8.43	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	MNT	Q99583	582 aa		8.43	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	8.43	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	GHITM	Q9H3K2	345 aa		8.43	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	CALY	Q9NYX4	217 aa		8.43	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	PSG11	Q9UQ72	335 aa		8.43	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2QL1	A1L167	161 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPB6	O14558	160 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	OVOL1	O14753	267 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	HSD17B6	O14756	317 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5H8	P0DN80	308 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKACB	P22694	351 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	DHFR2	Q86XF0	187 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	CHST4	Q8NCG5	386 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	RFESD	Q8TAC1	157 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	PP6455	Q8WZ26	134 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	COQ2	Q96H96	371 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	LRGUK	Q96M69	825 aa		8.42	□□□□□ -1.06

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