RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489053.1

HDAC6-232, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC6, Length 539 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-232ENST00000489053 CITED1Q99966 193 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 TMED9Q9BVK6 235 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 SELENOIQ9C0D9 397 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 CST11Q9H112 138 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 MMP27Q9H306 513 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 IL36GQ9NZH8 169 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 BLOC1S6Q9UL45 172 aa7.38□□□□□ -1.23
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HDAC6-232ENST00000489053 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.37□□□□□ -1.23
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HDAC6-232ENST00000489053 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.37□□□□□ -1.23
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HDAC6-232ENST00000489053 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 NOTCH1P46531 2555 aa7.37□□□□□ -1.23
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HDAC6-232ENST00000489053 A6NDX4 124 aa7.36□□□□□ -1.23
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HDAC6-232ENST00000489053 M0QZK8 103 aa7.36□□□□□ -1.23
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HDAC6-232ENST00000489053 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.36□□□□□ -1.23
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HDAC6-232ENST00000489053 MPIG6BO95866 241 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 MGMTP16455 207 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 MYF6P23409 242 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 CD24P25063 80 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 CD34P28906 385 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 SSTR5P35346 364 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 EFNB2P52799 333 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 TRAM1Q15629 374 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 C17orf58Q2M2W7 97 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.35□□□□□ -1.23
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