RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF329Q86UD4 541 aa5.17□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 EGFL6Q8IUX8 553 aa5.17□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 SLC35F2Q8IXU6 374 aa5.17□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 ABHD12Q8N2K0 398 aa5.17□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 OR4X2Q8NGF9 303 aa5.17□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 OR8J1Q8NGP2 316 aa5.17□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 OR13F1Q8NGS4 319 aa5.17□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 FCGR1BQ92637 280 aa5.17□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 DUX3Q96PT4 197 aa5.17□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.17□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 IRGMA1A4Y4 181 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 DHRS7CA6NNS2 312 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 RPP14O95059 124 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 IGKV1D-12P01611 117 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 GABRR1P24046 479 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 CDK2P24941 298 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 CD34P28906 385 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 ERP29P30040 261 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 GLIPR1P48060 266 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 P2RX3P56373 397 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF146Q15072 292 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 C9orf152Q5JTZ5 239 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 SLX4IPQ5VYV7 408 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 XAF1Q6GPH4 301 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 OR2W3Q7Z3T1 314 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 CATSPERDQ86XM0 798 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 OSR2Q8N2R0 312 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 RAB2BQ8WUD1 216 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 ISOC1Q96CN7 298 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 P2RX4Q99571 388 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 TBX5Q99593 518 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF649Q9BS31 505 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 MOB1AQ9H8S9 216 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 LINC00527Q9UJ94 153 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 SACSQ9NZJ4 4579 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 PSMB11A5LHX3 300 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 FAM90A18PA6NE21 464 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 FAM90A16PA6NEW6 464 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 C9orf118A6NHY6 69 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 LINC01548A6NM66 108 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 FAM90A12PA8MX19 464 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 SIRPB1O00241 398 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 MGST3O14880 152 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 WBP4O75554 376 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 APOL3O95236 402 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 CDK1P06493 297 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 FAM90A15PP0C7V4 464 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 FAM90A13PP0C7W8 464 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 FAM90A14PP0C7W9 464 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 FAM90A24PP0C7X0 464 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 PRKACAP17612 351 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 KIR3DL2P43630 455 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 FUT6P51993 359 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 AESQ08117 197 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 C17orf58Q2M2W7 97 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 HLA-DRB5Q30154 266 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 KLHL22Q53GT1 634 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 C12orf73Q69YU5 71 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 HEPN1Q6WQI6 88 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 AHSA2Q719I0 299 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 RDH10Q8IZV5 341 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 FAM58AQ8N1B3 248 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 PRSS35Q8N3Z0 413 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 LILRB2Q8N423 598 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 TCEANCQ8N8B7 351 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 CORO2AQ92828 525 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 RFKQ969G6 155 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 MUL1Q969V5 352 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 COQ2Q96H96 371 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 IL4I1Q96RQ9 567 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 BCL7BQ9BQE9 202 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 CHST5Q9GZS9 411 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 SLC7A11Q9UPY5 501 aa5.15□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms