RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411710.1

LIMS1-AS1-201, LIMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMS1-AS1, Length 477 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CXCR1P25024 350 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GDF1P27539 372 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RPL34P49207 117 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TAF6P49848 677 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CAV2P51636 162 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RAB38P57729 211 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LSM6P62312 80 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF45Q02386 682 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CDC20Q12834 499 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TBC1D28Q2M2D7 210 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TTMPQ5BVD1 217 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF493Q6ZR52 646 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C10orf67Q8IYJ2 551 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NPBQ8NG41 125 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OR4K17Q8NGC6 315 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPPL2BQ8TCT7 592 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZFP90Q8TF47 636 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RXFP2Q8WXD0 754 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TEAD3Q99594 435 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TIPINQ9BVW5 301 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRIM4Q9C037 500 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC25A22Q9H936 323 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC22A13Q9Y226 551 aa2.75□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PTPRJQ12913 1337 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GREB1Q4ZG55 1949 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 H7C423 109 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 J3QT63 122 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 M0R036 132 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LAD1O00515 517 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KMOO15229 486 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NPIPB7O75200 414 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UPK1BO75841 260 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ASS1P00966 412 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IGHV3-13P01766 116 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC35G6P0C7Q6 338 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 P0C879 139 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CD1EP15812 388 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UGT2B7P16662 529 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HTR1DP28221 377 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GRPRP30550 384 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CEACAM6P40199 344 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KIR3DL2P43630 455 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IDH2P48735 452 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SERPINB9P50453 376 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DLX6P56179 175 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GTF2BQ00403 316 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IL5RAQ01344 420 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BAXQ07812 192 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NAB1Q13506 487 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 Q1RN00 199 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LRRC10Q5BKY1 277 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LPCAT4Q643R3 524 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF720Q7Z2F6 126 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC25A42Q86VD7 318 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C11orf53Q8IXP5 236 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC34A3Q8N130 599 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZFP82Q8N141 532 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OR51Q1Q8NH59 317 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NEIL3Q8TAT5 605 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NT5CQ8TCD5 201 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LRRC29Q8WV35 223 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HGDQ93099 445 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SMIM19Q96E16 107 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC42Q96M95 316 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KCTD7Q96MP8 289 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF599Q96NL3 588 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRAP1Q96NZ9 151 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PSMB7Q99436 277 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NRIP2Q9BQI9 281 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CDCA4Q9BXL8 241 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC19A3Q9BZV2 496 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARL6Q9H0F7 186 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ASB7Q9H672 318 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MED4Q9NPJ6 270 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C12orf4Q9NQ89 552 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMEM9Q9P0T7 183 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GUCA1BQ9UMX6 200 aa2.74□□□□□ -1.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MOKQ9UQ07 419 aa2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms