RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368358.3

HCN3-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN3, Length 3,718 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3-201ENST00000368358 GGNBP1Q5YKI7 109 aa11.37□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 OR5A2Q8NGI9 324 aa11.37□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 LINC01560Q8TB33 94 aa11.37□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 SDHAF2Q9NX18 166 aa11.37□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 RNF150Q9ULK6 438 aa11.37□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 NKX2-6A6NCS4 301 aa11.37□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 CDK2AP1O14519 115 aa11.37□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 SUMF2Q8NBJ7 301 aa11.37□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 OR1S1Q8NH92 325 aa11.37□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 SSC4DQ8WTU2 575 aa11.37□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 C2orf50Q96LR7 162 aa11.37□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 LIME1Q9H400 295 aa11.37□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 DYNLRB1Q9NP97 96 aa11.37□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 TAAR3PQ9P1P4 343 aa11.37□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 MPC1Q9Y5U8 109 aa11.37□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 IGHV3-13P01766 116 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 IGHV3-7P01780 117 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 ALDH3B1P43353 468 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 CCL8P80075 99 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 OR2B11Q5JQS5 317 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 KIRREL1Q96J84 757 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 ARPC5LQ9BPX5 153 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 SFXN3Q9BWM7 321 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 K7EPK0 472 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 MSTNO14793 375 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 KLRB1Q12918 225 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 ZNF154Q13106 437 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 CLLU1Q5K131 121 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 TECTBQ96PL2 329 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 PPYP01298 95 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 FAM201AQ5SY85 155 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 TMEM42Q69YG0 159 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 TMEM108Q6UXF1 575 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 SCCPDHQ8NBX0 429 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 FAHD2AQ96GK7 314 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 PLSCR2Q9NRY7 297 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 LRRK2Q5S007 2527 aa11.36□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 PQLC2LA1A4F0 135 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 MSGN1A6NI15 193 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 OR2F2O95006 317 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 PET100P0DJ07 73 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 S100GP29377 79 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 EDDM3BP56851 147 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 FGF12P61328 243 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 OR2F1Q13607 317 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 HNF4GQ14541 408 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 OR10J5Q8NHC4 309 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 RFESDQ8TAC1 157 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 TNFSF18Q9UNG2 199 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 AMDHD2Q9Y303 409 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 A8MXE2 369 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 CMTM1Q8IZ96 169 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 OR5P3Q8WZ94 311 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 HRH4Q9H3N8 390 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 OPA3Q9H6K4 179 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 CCL28Q9NRJ3 127 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 OR5B21A6NL26 309 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 B8ZZF3 427 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 RAC2P15153 192 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 AANATQ16613 207 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 MOGAT3Q86VF5 341 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 DNTTIP1Q9H147 329 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 RAB18Q9NP72 206 aa11.35□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 TSPAN4O14817 238 aa11.34□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 BCL2L11O43521 198 aa11.34□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 TUSC2O75896 110 aa11.34□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 PRH1P02810 166 aa11.34□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 OR8U9P0C7N5 309 aa11.34□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 P2RX3P56373 397 aa11.34□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 UBA52P62987 128 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 SLC25A24Q6NUK1 477 aa11.34□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 GAPTQ8N292 157 aa11.34□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 OR8U1Q8NH10 309 aa11.34□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 LRRC29Q8WV35 223 aa11.34□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 ATPIF1Q9UII2 106 aa11.34□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 HSF4Q9ULV5 492 aa11.34□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 CENPEQ02224 2701 aa11.34□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 DTYMKP23919 212 aa11.34□□□□□ -0.59
HCN3-201ENST00000368358 TIMM23BQ5SRD1 257 aa11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.2 ms