RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP1.1□□□□□ -2.23
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARAP3Q8WWN8 1544 aa1.1□□□□□ -2.23
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ERICH4A6NGS2 130 aa1.09□□□□□ -2.23
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLHC1Q8NHS4 586 aa1.05□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AGR3Q8TD06 166 aa1.05□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DCANP1Q8TF63 244 aa1.05□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VAT1Q99536 393 aa1.05□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC19A3Q9BZV2 496 aa1.05□□□□□ -2.24
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CASC3O15234 703 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CA2P00918 260 aa1.04□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GZMBP10144 247 aa1.04□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C2orf80Q0P641 193 aa1.04□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP1.04□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR8G1Q15617 311 aa1.04□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CD200R1Q8TD46 325 aa1.04□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CAPZA3Q96KX2 299 aa1.04□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BIRC8Q96P09 236 aa1.04□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FBXO44Q9H4M3 255 aa1.04□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNIP2Q9NS61 270 aa1.04□□□□□ -2.24
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