RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489053.1

HDAC6-232, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC6, Length 539 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-232ENST00000489053 C16orf95Q9H693 158 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 RAB9BQ9NP90 201 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 TAS2R3Q9NYW6 316 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 ST3GAL6Q9Y274 331 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 A0A1W2PPK0 400 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 FAM172BPA6NC97 362 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 ODF3BA8MYP8 253 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 OGG1O15527 345 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 TSPAN9O75954 239 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 CDRT1O95170 752 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 MAS1P04201 325 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 CSN2P05814 226 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 PAX6P26367 422 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 PIGYQ3MUY2 71 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 AWAT2Q6E213 333 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 ELP2Q6IA86 826 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 HEPN1Q6WQI6 88 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 OR13C5Q8NGS8 318 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 OR14A2Q96R54 314 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 ZNF649Q9BS31 505 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 CDCA4Q9BXL8 241 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 SPACA1Q9HBV2 294 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 DPM3Q9P2X0 92 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 TPRKBQ9Y3C4 175 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC6-232ENST00000489053 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 VGLL3A8MV65 326 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 LMO1P25800 156 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 HSPA13P48723 471 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 RAB13P51153 203 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 RBM11P57052 281 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 MED22Q15528 200 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 LTC4SQ16873 150 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 Q6P435 159 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 RNF144BQ7Z419 303 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 TMEM219Q86XT9 240 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 OR51T1Q8NGJ9 327 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 OR10X1Q8NGY0 326 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 MRGPRDQ8TDS7 321 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 TFAP2CQ92754 450 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 MUL1Q969V5 352 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 RPEQ96AT9 228 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 CCDC90BQ9GZT6 254 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 CALYQ9NYX4 217 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 KIF25Q9UIL4 384 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 TCF19Q9Y242 345 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 VWFP04275 2813 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 MEGF11A6BM72 1044 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 LALBAP00709 142 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 IL1AP01583 271 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 CSF1P09603 554 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 HSMCR30P0CW71 290 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 FSTP19883 344 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 IL3RAP26951 378 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 KIR2DS4P43632 304 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 GNG10P50151 68 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 PROK1P58294 105 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 BDH1Q02338 343 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 DOC2BQ14184 412 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 HERPUD1Q15011 391 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 MPV17LQ2QL34 196 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 GLT8D1Q68CQ7 371 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 ZNF529Q6P280 563 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 TCF23Q7RTU1 214 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 SUMF2Q8NBJ7 301 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 OR9G1Q8NH87 305 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 CORO2AQ92828 525 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 UFD1Q92890 307 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 TOMM40LQ969M1 308 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-232ENST00000489053 ORAI1Q96D31 301 aa7.38□□□□□ -1.23
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