RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423161.3

SREBF1-206, Transcript of sterol regulatory element binding transcription factor 1, human

TSL 3

Gene SREBF1, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SREBF1-206	ENST00000423161	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	OOSP1	A8MZH6	123 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161		E9PI62	339 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	LY6L	H3BQJ8	138 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	PF4	P02776	101 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	AMY1A	P04745	511 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	AMY2A	P04746	511 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	CCDC159	P0C7I6	412 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	IGLL1	P15814	213 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	OR9G1	Q8NH87	305 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	MYDGF	Q969H8	173 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	AMBN	Q9NP70	447 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	KIF25	Q9UIL4	384 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	MPZL2	O60487	215 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	ZSCAN26	Q16670	478 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	ELP2	Q6IA86	826 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	PXT1	Q8NFP0	134 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	TOMM40L	Q969M1	308 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	RPE	Q96AT9	228 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161		Q96MT0	163 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	GPER1	Q99527	375 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	ZNF649	Q9BS31	505 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	CALY	Q9NYX4	217 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161		M0QZK8	103 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	GABRP	O00591	440 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	CGB3	P0DN86	165 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	CGB7	P0DN87	165 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	RAB3A	P20336	220 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	RAB40B	Q12829	278 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	SATL1	Q86VE3	508 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-206	ENST00000423161	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161		J3QR06	171 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	MAGEB3	O15480	346 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	IL1A	P01583	271 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	IGHV3-7	P01780	117 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	FAM106CP	P0CH98	169 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	SOX2	P48431	317 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	SLC35A2	P78381	396 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	IL13RA2	Q14627	380 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	LEAP2	Q969E1	77 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	RSU1	Q15404	277 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	LTC4S	Q16873	150 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	PIGY	Q3MUY2	71 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	ZNF529	Q6P280	563 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	OSR2	Q8N2R0	312 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	OR56B4	Q8NH76	319 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	JAM3	Q9BX67	310 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161		A0A1W2PPI3	338 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	HTR3B	O95264	441 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	CLIC3	O95833	236 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-206	ENST00000423161	MPIG6B	O95866	241 aa		14.68	□□□□□ -0.06

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