RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278833.3

ROM1-201, Transcript of retinal outer segment membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ROM1, Length 1,878 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1-201ENST00000278833 OR11L1Q8NGX0 322 aa21.49■■□□□ 1.03
ROM1-201ENST00000278833 APH1AQ96BI3 265 aa21.49■■□□□ 1.03
ROM1-201ENST00000278833 TP53RKQ96S44 253 aa21.49■■□□□ 1.03
ROM1-201ENST00000278833 SPACA1Q9HBV2 294 aa21.49■■□□□ 1.03
ROM1-201ENST00000278833 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ROM1-201ENST00000278833 CELA3AP09093 270 aa21.48■■□□□ 1.03
ROM1-201ENST00000278833 PAX6P26367 422 aa21.48■■□□□ 1.03
ROM1-201ENST00000278833 FOXC1Q12948 553 aa21.48■■□□□ 1.03
ROM1-201ENST00000278833 SWI5Q1ZZU3 235 aa21.48■■□□□ 1.03
ROM1-201ENST00000278833 SLC35G3Q8N808 338 aa21.48■■□□□ 1.03
ROM1-201ENST00000278833 IP6K3Q96PC2 410 aa21.48■■□□□ 1.03
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ROM1-201ENST00000278833 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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ROM1-201ENST00000278833 IGHV3-9P01782 118 aa21.47■■□□□ 1.03
ROM1-201ENST00000278833 WNT2P09544 360 aa21.47■■□□□ 1.03
ROM1-201ENST00000278833 GNRHRP30968 328 aa21.47■■□□□ 1.03
ROM1-201ENST00000278833 DCAF10Q5QP82 559 aa21.47■■□□□ 1.03
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ROM1-201ENST00000278833 TMEM251Q8N6I4 163 aa21.47■■□□□ 1.03
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ROM1-201ENST00000278833 SFTA3P0C7M3 94 aa21.47■■□□□ 1.03
ROM1-201ENST00000278833 NPBWR1P48145 328 aa21.47■■□□□ 1.03
ROM1-201ENST00000278833 IL22RA2Q969J5 263 aa21.47■■□□□ 1.03
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ROM1-201ENST00000278833 IGSF11Q5DX21 431 aa21.46■■□□□ 1.03
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ROM1-201ENST00000278833 IFT22Q9H7X7 185 aa21.46■■□□□ 1.03
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ROM1-201ENST00000278833 ATP23Q9Y6H3 246 aa21.46■■□□□ 1.03
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ROM1-201ENST00000278833 OR5B21A6NL26 309 aa21.45■■□□□ 1.02
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ROM1-201ENST00000278833 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
ROM1-201ENST00000278833 ZNF565Q8N9K5 539 aa21.43■■□□□ 1.02
ROM1-201ENST00000278833 OR8U1Q8NH10 309 aa21.43■■□□□ 1.02
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