RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 BMP6P22004 513 aa3.49□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 ADH7P40394 386 aa3.49□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 ARID5AQ03989 594 aa3.49□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 TTBK2Q6IQ55 1244 aa3.49□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa3.49□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 TXNDC11Q6PKC3 985 aa3.49□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 SV2BQ7L1I2 683 aa3.49□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 GOLM1Q8NBJ4 401 aa3.49□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 TNFRSF25Q93038 417 aa3.49□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM74Q96NL1 305 aa3.49□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 LPIN3Q9BQK8 851 aa3.49□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF576Q9H609 170 aa3.49□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 SLC6A14Q9UN76 642 aa3.49□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 STARD13Q9Y3M8 1113 aa3.49□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 ERBB4Q15303 1308 aa3.48□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP3.48□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 GARTP22102 1010 aa3.48□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 LIG3P49916 1009 aa3.48□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF787Q6DD87 383 aa3.48□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 VPS37DQ86XT2 251 aa3.48□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 IL22RA1Q8N6P7 574 aa3.48□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 PHC3Q8NDX5 983 aa3.48□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 FBXO27Q8NI29 283 aa3.48□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 BSNDQ8WZ55 320 aa3.48□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 CEP44Q9C0F1 390 aa3.48□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 RBSNQ9H1K0 784 aa3.48□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM39AQ9NV64 488 aa3.48□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 UBP1Q9NZI7 540 aa3.48□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 MRVI1Q9Y6F6 885 aa3.48□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 IGF1RP08069 1367 aa3.48□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 H3BM21 787 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 LINC01387J3KSC0 135 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 TLR3O15455 904 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 GREM1O60565 184 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 ECEL1O95672 775 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 ARAFP10398 606 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 EPHA1P21709 976 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 ALAS2P22557 587 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 ADH6P28332 368 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 BAG6P46379 1132 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 KRT76Q01546 638 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 PCDH1Q08174 1060 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 GRIK5Q16478 980 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 PCSK7Q16549 785 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 ELOA3BQ3SY89 546 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 PCNX4Q63HM2 1172 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 KANK3Q6NY19 840 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 DPH6Q7L8W6 267 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 MCF2L2Q86YR7 1114 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 GALNT6Q8NCL4 622 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 ELOA3Q8NG57 546 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 SLC7A3Q8WY07 619 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 UBXN4Q92575 508 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 ACDQ96AP0 544 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 GPRASP2Q96D09 838 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 GMLQ99445 158 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 ADAM19Q9H013 955 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 CBX8Q9HC52 389 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 MBIPQ9NS73 344 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 GINM1Q9NU53 330 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 PPM1HQ9ULR3 514 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 SOX13Q9UN79 622 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 EFR3BQ9Y2G0 817 aa3.47□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 TERTO14746 1132 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SPTAN1-232ENST00000636483 CDC27P30260 824 aa3.46□□□□□ -1.86
SPTAN1-232ENST00000636483 ETFBP38117 255 aa3.46□□□□□ -1.86
SPTAN1-232ENST00000636483 CRKP46108 304 aa3.46□□□□□ -1.86
SPTAN1-232ENST00000636483 GJA8P48165 433 aa3.46□□□□□ -1.86
SPTAN1-232ENST00000636483 NASPP49321 788 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SPTAN1-232ENST00000636483 CDK8P49336 464 aa3.46□□□□□ -1.86
SPTAN1-232ENST00000636483 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SPTAN1-232ENST00000636483 RBL2Q08999 1139 aa3.46□□□□□ -1.86
SPTAN1-232ENST00000636483 SEPT6Q14141 434 aa3.46□□□□□ -1.86
SPTAN1-232ENST00000636483 IKBKEQ14164 716 aa3.46□□□□□ -1.86
SPTAN1-232ENST00000636483 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SPTAN1-232ENST00000636483 AGMOQ6ZNB7 445 aa3.46□□□□□ -1.86
SPTAN1-232ENST00000636483 C20orf204Q6ZNR8 217 aa3.46□□□□□ -1.86
SPTAN1-232ENST00000636483 KIAA0825Q8IV33 1275 aa3.46□□□□□ -1.86
SPTAN1-232ENST00000636483 ANKRD24Q8TF21 1146 aa3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms