RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 TBCAO75347 108 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 TMCO3Q6UWJ1 677 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM75PA6NK02 468 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 NAPAP54920 295 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 APPBP2Q92624 585 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 UBA5Q9GZZ9 404 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 VAT1LQ9HCJ6 419 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 STX8Q9UNK0 236 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 PHKG2P15735 406 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 GNA11P29992 359 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 LPIN2Q92539 896 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 SUCLG2Q96I99 432 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 ABCA6Q8N139 1617 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 ALKQ9UM73 1620 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 PPP1R2P41236 205 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 HSPA2P54652 639 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 APOBRQ0VD83 1088 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 ANO6Q4KMQ2 910 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 USP37Q86T82 979 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 OGFOD1Q8N543 542 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 XAGE2Q96GT9 111 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 SLAIN2Q9P270 581 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 TNNT1P13805 278 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 HS1BP3Q53T59 392 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 STK24Q9Y6E0 443 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 SGSM2O43147 1006 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 IGSF1Q8N6C5 1336 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 PAFAH1B1P43034 410 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 RRAGBQ5VZM2 374 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 TTC6Q86TZ1 520 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 CNBD1Q8NA66 436 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC2Q9BYS8 371 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 NCAPD2Q15021 1401 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 BICDL2A1A5D9 508 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 NEURL1BA8MQ27 555 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 GNPATO15228 680 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 RRP9O43818 475 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM47Q96LD4 638 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 SNX14Q9Y5W7 946 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 GIMAP6Q6P9H5 292 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 MPNDQ8N594 471 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 KBTBD3Q8NAB2 608 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 MCM9Q9NXL9 1143 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 FBXO3Q9UK99 471 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 BIN1O00499 593 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 UBASH3AP57075 661 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 SH2D4AQ9H788 454 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 B4DLN1 442 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 H0YHG0 523 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 MBD4O95243 580 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 DEXIO95424 95 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 ATP5JP18859 108 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 MED14O60244 1454 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 ELP1O95163 1332 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 PSMA7O14818 248 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 KIAA0754O94854 1291 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 RBM10P98175 930 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 WDR66Q8TBY9 1149 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 GLT8D2Q9H1C3 349 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 SSH3Q8TE77 659 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 TM6SF1Q9BZW5 370 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 A2ML1A8K2U0 1454 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 ROBO2Q9HCK4 1378 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 URI1O94763 535 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 SYCP3Q8IZU3 236 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 SCLT1Q96NL6 688 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 CRACR2AQ9BSW2 395 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 DACT1Q9NYF0 836 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 TNNI2P48788 182 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 PICALMQ13492 652 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 TBC1D5Q92609 795 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-228ENST00000636120 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms