RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602414.5

SNHG8-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 8, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNHG8, Length 672 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG8-201ENST00000602414 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.32■□□□□ 0.84
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SNHG8-201ENST00000602414 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.32■□□□□ 0.84
SNHG8-201ENST00000602414 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
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SNHG8-201ENST00000602414 SPDYE6P0CI01 402 aa20.31■□□□□ 0.84
SNHG8-201ENST00000602414 SP3Q02447 781 aa20.31■□□□□ 0.84
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SNHG8-201ENST00000602414 CFAP100Q494V2 611 aa20.3■□□□□ 0.84
SNHG8-201ENST00000602414 TSPYL6Q8N831 410 aa20.3■□□□□ 0.84
SNHG8-201ENST00000602414 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.3■□□□□ 0.84
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SNHG8-201ENST00000602414 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SNHG8-201ENST00000602414 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.28■□□□□ 0.84
SNHG8-201ENST00000602414 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.27■□□□□ 0.84
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SNHG8-201ENST00000602414 CASP7P55210 303 aa20.27■□□□□ 0.84
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SNHG8-201ENST00000602414 LINS1Q8NG48 757 aa20.27■□□□□ 0.84
SNHG8-201ENST00000602414 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SNHG8-201ENST00000602414 PTPN18Q99952 460 aa20.26■□□□□ 0.83
SNHG8-201ENST00000602414 F8W031 263 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SNHG8-201ENST00000602414 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SNHG8-201ENST00000602414 GJA5P36382 358 aa20.25■□□□□ 0.83
SNHG8-201ENST00000602414 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
SNHG8-201ENST00000602414 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SNHG8-201ENST00000602414 DNAAF4Q8WXU2 420 aa20.25■□□□□ 0.83
SNHG8-201ENST00000602414 TAF5LO75529 589 aa20.24■□□□□ 0.83
SNHG8-201ENST00000602414 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SNHG8-201ENST00000602414 FLIIQ13045 1269 aa20.24■□□□□ 0.83
SNHG8-201ENST00000602414 OPTNQ96CV9 577 aa20.24■□□□□ 0.83
SNHG8-201ENST00000602414 ZNF333Q96JL9 665 aa20.24■□□□□ 0.83
SNHG8-201ENST00000602414 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SNHG8-201ENST00000602414 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.24■□□□□ 0.83
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SNHG8-201ENST00000602414 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.23■□□□□ 0.83
SNHG8-201ENST00000602414 BRCA2P51587 3418 aa20.23■□□□□ 0.83
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SNHG8-201ENST00000602414 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SNHG8-201ENST00000602414 ELP3Q9H9T3 547 aa20.22■□□□□ 0.83
SNHG8-201ENST00000602414 SNAP23O00161 211 aa20.21■□□□□ 0.83
SNHG8-201ENST00000602414 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.21■□□□□ 0.83
SNHG8-201ENST00000602414 TNNI2P48788 182 aa20.2■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.19■□□□□ 0.82
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SNHG8-201ENST00000602414 MAP3K9P80192 1104 aa20.19■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 FOXO4P98177 505 aa20.19■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 CCL15Q16663 113 aa20.19■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.19■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.19■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.19■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa20.19■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.19■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 CSADQ9Y600 493 aa20.19■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 IL16Q14005 1332 aa20.19■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 LAMB1P07942 1786 aa20.18■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 SPEF2Q9C093 1822 aa20.18■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 KIF22Q14807 665 aa20.18■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.18■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.18■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.18■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 VGLL4Q14135 290 aa20.17■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 UBE4AQ14139 1066 aa20.17■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 WWC1Q8IX03 1113 aa20.17■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SNHG8-201ENST00000602414 TEPSINQ96N21 525 aa20.17■□□□□ 0.82
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