RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 KANSL3Q9P2N6 904 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAK1Q9UPV9 953 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa5.79□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 GARTP22102 1010 aa5.79□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 FCGRTP55899 365 aa5.79□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB33AQ14088 237 aa5.79□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa5.79□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 BRINP2Q9C0B6 783 aa5.79□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 ABCB6Q9NP58 842 aa5.79□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 NDFIP2Q9NV92 336 aa5.79□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 STRIP2Q9ULQ0 834 aa5.79□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNH4Q9UQ05 1017 aa5.79□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa5.79□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC18Q5T9S5 1454 aa5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM221BA6H8Z2 402 aa5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 GREM1O60565 184 aa5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 RLBP1P12271 317 aa5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 ACPPP15309 386 aa5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 TNP2Q05952 138 aa5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 CCINQ13939 588 aa5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 LBRQ14739 615 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP3K11Q16584 847 aa5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 SV2BQ7L1I2 683 aa5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 PHC3Q8NDX5 983 aa5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 RHOVQ96L33 236 aa5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM55Q9BYV6 548 aa5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 SNTG2Q9NY99 539 aa5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 PPM1HQ9ULR3 514 aa5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 TLR6Q9Y2C9 796 aa5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 AKAP2Q9Y2D5 859 aa5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 NFKBIEO00221 500 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXO24O75426 580 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 PF4P02776 101 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 EDN3P14138 238 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM160A1Q05DH4 1040 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 SCARF1Q14162 830 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 RASA3Q14644 834 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 CCNJLQ8IV13 435 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 CPLX3Q8WVH0 158 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 ANAPC16Q96DE5 110 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 DEPDC7Q96QD5 511 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 IFT57Q9NWB7 429 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 UBP1Q9NZI7 540 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 PRKAG3Q9UGI9 489 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 GJA3Q9Y6H8 435 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 UGGT2Q9NYU1 1516 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 KIAA0556O60303 1618 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 CLSPNQ9HAW4 1339 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC35F4A4IF30 521 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 LIG3P49916 1009 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 ANAPC15P60006 121 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 PCNX4Q63HM2 1172 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 DTHD1Q6ZMT9 781 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 KRT25Q7Z3Z0 450 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 LRP10Q7Z4F1 713 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 CRIPAKQ8N1N5 446 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 CEP120Q8N960 986 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM187AA6NFU0 413 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 BNIP3LO60238 219 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 TRPA1O75762 1119 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 CELA3AP09093 270 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 MAPTP10636 758 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 SOX18P35713 384 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 GRIA4P48058 902 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 LAMC2Q13753 1193 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 TPTE2Q6XPS3 522 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 PGBD3Q8N328 593 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 GOLM1Q8NBJ4 401 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 NKD1Q969G9 470 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 SHDQ96IW2 340 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC30A3Q99726 388 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 KANSL2Q9H9L4 492 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 LIN7BQ9HAP6 207 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-210ENST00000590211 PCDH12Q9NPG4 1184 aa5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms