RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582717.5

GGA3-214, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GGA3, Length 2,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-214ENST00000582717 LRP5O75197 1615 aa16.01■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 SCARF1Q14162 830 aa16.01■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 METTL24Q5JXM2 366 aa16.01■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 TTC39AQ5SRH9 613 aa16.01■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa16.01■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 HELLSQ9NRZ9 838 aa16.01■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 CCDC158Q5M9N0 1113 aa16■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 GORABQ5T7V8 394 aa16■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 MAST3O60307 1309 aa16■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa15.99■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 FAM177BA6PVY3 158 aa15.99■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 CYP21A2P08686 494 aa15.99■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 LIG1P18858 919 aa15.99■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 CDC37L1Q7L3B6 337 aa15.99■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 NECAB1Q8N987 351 aa15.99■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 CLSTN2Q9H4D0 955 aa15.99■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 CBX8Q9HC52 389 aa15.99■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 CAMTA2O94983 1202 aa15.99■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 SUSD4Q5VX71 490 aa15.99■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 LUZP1Q86V48 1076 aa15.99■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 PLA2G4DQ86XP0 818 aa15.99■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 VGLL2Q8N8G2 317 aa15.99■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 CNNM1Q9NRU3 951 aa15.99■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa15.99■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 LAMA4Q16363 1823 aa15.99■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 ZNF75DP51815 510 aa15.98■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 TICAM2Q86XR7 235 aa15.98■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 BCL9LQ86UU0 1499 aa15.98■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 AKAP11Q9UKA4 1901 aa15.98■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 M0R2C6 588 aa15.98■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 CDC25BP30305 580 aa15.98■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 KRT32Q14532 448 aa15.98■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 ANO6Q4KMQ2 910 aa15.98■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 PI16Q6UXB8 463 aa15.98■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 CCDC186Q7Z3E2 898 aa15.98■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 SPATA32Q96LK8 384 aa15.98■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 DACT1Q9NYF0 836 aa15.98■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 DRC7Q8IY82 874 aa15.97■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 C8orf37Q96NL8 207 aa15.97■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 MYH7P12883 1935 aa15.97■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 UBAP1LF5GYI3 381 aa15.97■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 ZAP70P43403 619 aa15.97■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 STOX1Q6ZVD7 989 aa15.97■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 NEK1Q96PY6 1258 aa15.97■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 DSCC1Q9BVC3 393 aa15.97■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 TRIM5Q9C035 493 aa15.97■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 BCORQ6W2J9 1755 aa15.96■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 CAMK4Q16566 473 aa15.96■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa15.96■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 OSBP2Q969R2 916 aa15.96■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 OGFRQ9NZT2 677 aa15.96■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 ABCC12Q96J65 1359 aa15.96■□□□□ 0.15
GGA3-214ENST00000582717 A0A0G2JLW4 131 aa15.96■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 FERMT3Q86UX7 667 aa15.96■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 LAMB2P55268 1798 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 ARAP2Q8WZ64 1704 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 NEMFO60524 1076 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 MCAMP43121 646 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 VPS72Q15906 364 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 CKAP2LQ8IYA6 745 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 NGLY1Q96IV0 654 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 ZNF831Q5JPB2 1677 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 PDE8BO95263 885 aa15.94■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 AK7Q96M32 723 aa15.94■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 TNNT1P13805 278 aa15.94■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.141e-9■■■□□ 18.3
GGA3-214ENST00000582717 ZNF165P49910 485 aa15.94■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 LINC00116Q8NCU8 138 aa15.94■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 CCDC112Q8NEF3 446 aa15.94■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 NTSR2O95665 410 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 SARM1Q6SZW1 724 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 FOXP2O15409 715 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 KCNQ4P56696 695 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 LRMPQ12912 555 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 PARP10Q53GL7 1025 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 Q6ZUG5 572 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 PTF1AQ7RTS3 328 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 SEC31BQ9NQW1 1179 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 CLIP2Q9UDT6 1046 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.92■□□□□ 0.14
GGA3-214ENST00000582717 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms