RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574468.1

PAFAH1B1-208, Transcript of platelet activating factor acetylhydrolase 1b regulatory subunit 1, human

TSL 2

Gene PAFAH1B1, Length 1,021 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	CFAP53	Q96M91	514 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	NARF	Q9UHQ1	456 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	WFS1	O76024	890 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	RASSF7	Q02833	373 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	BCS1L	Q9Y276	419 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	BMP1	P13497	986 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	SCARF1	Q14162	830 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	ANXA1	P04083	346 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	SERPINB2	P05120	415 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	TIMP2	P16035	220 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	NFE2L2	Q16236	605 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	HLF	Q16534	295 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	PROSER3	Q2NL68	480 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	PNMA1	Q8ND90	353 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	COL4A5	P29400	1685 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	ABCC12	Q96J65	1359 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	ZNF428	Q96B54	188 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	NUDC	Q9Y266	331 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	AP1G2	O75843	785 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	GRM5	P41594	1212 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	TGFB2	P61812	414 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	OLFM4	Q6UX06	510 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	GOPC	Q9HD26	462 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	NGEF	Q8N5V2	710 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	ZFP42	Q96MM3	310 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	SNED1	Q8TER0	1413 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	NFKBIE	O00221	500 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	GRIN3B	O60391	1043 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	C1QTNF8	P60827	252 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	NEUROD2	Q15784	382 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	FAM177B	A6PVY3	158 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	UPP2	O95045	317 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	STARD3NL	O95772	234 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	FSHR	P23945	695 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	RALBP1	Q15311	655 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	NR6A1	Q15406	480 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	WDR90	Q96KV7	1748 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	LTBP1	Q14766	1721 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	MYL6B	P14649	208 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	RIPK4	P57078	832 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	ZBTB33	Q86T24	672 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	ITPKC	Q96DU7	683 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	PIM2	Q9P1W9	311 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	SPEF2	Q9C093	1822 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	NR3C2	P08235	984 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	PTK2	Q05397	1052 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	ERFE	Q4G0M1	354 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	SYNE4	Q8N205	404 aa		10.04	□□□□□ -0.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63 ms