RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 NPHP1O15259 732 aa24.88■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 MAGEB6Q8N7X4 407 aa24.88■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 SPEF2Q9C093 1822 aa24.88■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 RFC4P35249 363 aa24.87■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.87■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 FERMT3Q86UX7 667 aa24.87■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 IL27Q8NEV9 243 aa24.87■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 CNPY2Q9Y2B0 182 aa24.87■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.86■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 MTMR6Q9Y217 621 aa24.86■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 KLRK1P26718 216 aa24.86■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.86■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 DDX11Q96FC9 970 aa24.86■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 TRIM37O94972 964 aa24.85■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 PANK2Q9BZ23 570 aa24.85■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 FAM173BQ6P4H8 233 aa24.85■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 INCENPQ9NQS7 918 aa24.85■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa24.84■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 FSD2A1L4K1 749 aa24.84■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 PTMSP20962 102 aa24.84■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 USP48Q86UV5 1035 aa24.84■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 NLRP3Q96P20 1036 aa24.84■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 LRP5O75197 1615 aa24.84■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 F13A1P00488 732 aa24.84■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa24.84■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 RTL9Q8NET4 1388 aa24.83■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 SCRN1Q12765 414 aa24.83■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 FOSBP53539 338 aa24.83■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.83■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 CDC37L1Q7L3B6 337 aa24.83■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 ABCF2Q9UG63 623 aa24.83■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 ATRNO75882 1429 aa24.82■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 BCORQ6W2J9 1755 aa24.82■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.82■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 MIGA1Q8NAN2 632 aa24.82■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 GTF3C6Q969F1 213 aa24.82■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 ARMT1Q9H993 441 aa24.82■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.82■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 TICAM2Q86XR7 235 aa24.82■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 STK11IPQ8N1F8 1099 aa24.82■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 AIDAQ96BJ3 306 aa24.82■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF213O14771 459 aa24.81■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 UBE3CQ15386 1083 aa24.81■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 NBPF3Q9H094 633 aa24.81■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 CTNNA3Q9UI47 895 aa24.81■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 PRKAB2O43741 272 aa24.81■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 NFIXQ14938 502 aa24.81■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24.81■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 TCHHQ07283 1943 aa24.8■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 FIBPO43427 364 aa24.8■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 MBD4O95243 580 aa24.8■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 NYXQ9GZU5 481 aa24.8■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.8■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 NHSQ6T4R5 1651 aa24.8■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 MAP3K12Q12852 859 aa24.8■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM63CQ9P1W3 806 aa24.79■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 JAG2Q9Y219 1238 aa24.79■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa24.79■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 VPS37DQ86XT2 251 aa24.78■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24.78■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 ADGRA1Q86SQ6 560 aa24.78■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 LAMA4Q16363 1823 aa24.77■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 TM4SF1P30408 202 aa24.77■■□□□ 1.56
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.76■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 PRC1O43663 620 aa24.76■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 CTDNEP1O95476 244 aa24.76■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 ANTXR2P58335 489 aa24.76■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 KRT27Q7Z3Y8 459 aa24.76■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 LCORLQ8N3X6 602 aa24.76■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.76■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 GRPEL1Q9HAV7 217 aa24.76■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 RAI14Q9P0K7 980 aa24.75■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.75■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 PFKFB2O60825 505 aa24.74■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms