RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	JMY	Q8N9B5	988 aa		14.06	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		14.06	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	GML	Q99445	158 aa		14.06	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		14.06	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	14.05	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	RASSF10	A6NK89	507 aa		14.05	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246		F8W031	263 aa	Predicted RBP	14.05	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	14.05	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	GRM1	Q13255	1194 aa		14.05	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	14.05	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		14.05	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	MAST3	O60307	1309 aa		14.05	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	SNAP23	O00161	211 aa		14.04	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	14.04	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	14.04	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	14.04	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP2B3	Q16720	1220 aa		14.04	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		14.04	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	14.04	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		14.04	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	14.04	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	14.04	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	COPRS	Q9NQ92	184 aa		14.04	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		14.04	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	HUNK	P57058	714 aa		14.03	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	TNFAIP1	Q13829	316 aa		14.03	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	GORAB	Q5T7V8	394 aa		14.03	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		14.03	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	MXD3	Q9BW11	206 aa		14.03	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	14.03	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		14.03	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	14.03	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1B0GUL6	1792 aa		14.02	□□□□□ -0.16
TTLL3-231	ENST00000496246	ADM5	C9JUS6	153 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	WNT10B	O00744	389 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	EGFR	P00533	1210 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	VEGFB	P49765	207 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	FKBP1B	P68106	108 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC102A	Q96A19	550 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	CAPNS2	Q96L46	248 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	JAG2	Q9Y219	1238 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	CEP350	Q5VT06	3117 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	SEMA3E	O15041	775 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	TNNI2	P48788	182 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	MTX1	Q13505	466 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	CFAP100	Q494V2	611 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	CST9	Q5W186	159 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	CDCA5	Q96FF9	252 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	VEZT	Q9HBM0	779 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP2K2	P36507	400 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	BCAM	P50895	628 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	TEKT1	Q969V4	418 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	FGFR2	P21802	821 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	NOG	Q13253	232 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	RGMB	Q6NW40	437 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	SLF2	Q8IX21	1173 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	HMMR	O75330	724 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	SPDYE6	P0CI01	402 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	HOOK2	Q96ED9	719 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	CA12	O43570	354 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	CRK	P46108	304 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP8B2	P98198	1209 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	CERS5	Q8N5B7	392 aa		13.97	□□□□□ -0.17

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