RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495188.2

RNF146-208, Transcript of ring finger protein 146, human

TSL 2

Gene RNF146, Length 593 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF146-208	ENST00000495188	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
RNF146-208	ENST00000495188	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
RNF146-208	ENST00000495188	IKBKE	Q14164	716 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RNF146-208	ENST00000495188	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RNF146-208	ENST00000495188	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RNF146-208	ENST00000495188	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RNF146-208	ENST00000495188	SPG7	Q9UQ90	795 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RNF146-208	ENST00000495188	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RNF146-208	ENST00000495188	C9orf172	C9J069	976 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RNF146-208	ENST00000495188	DLL1	O00548	723 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RNF146-208	ENST00000495188	ITPKA	P23677	461 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RNF146-208	ENST00000495188	ARL4D	P49703	201 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RNF146-208	ENST00000495188	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RNF146-208	ENST00000495188	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RNF146-208	ENST00000495188	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RNF146-208	ENST00000495188	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	GIPC1	O14908	333 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	SELP	P16109	830 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	PCDH1	Q08174	1060 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	FRMD6	Q96NE9	622 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF576	Q9H609	170 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	CHRNA4	P43681	627 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	FCGRT	P55899	365 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	CD163	Q86VB7	1156 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	USP21	Q9UK80	565 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	TM4SF5	O14894	197 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	GNA15	P30679	374 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	C12orf49	Q9H741	205 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	GSTT1	P30711	240 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	ADGRE1	Q14246	886 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF146-208	ENST00000495188	B3GALT4	O96024	378 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	ITGB2	P05107	769 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	NLRP12	P59046	1061 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	GSTM4	Q03013	218 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	MBTPS1	Q14703	1052 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	PARP2	Q9UGN5	583 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	ADAM11	O75078	769 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	GATA4	P43694	442 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	ACAD11	Q709F0	780 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	RNF19A	Q9NV58	838 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	AK5	Q9Y6K8	562 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188		F8W735	103 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	WISP1	O95388	367 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	IGHA1	P01876	353 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	USP17L7	P0C7H9	530 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	DAB2	P98082	770 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	FAAP100	Q0VG06	881 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	PSMD2	Q13200	908 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	MSTN	O14793	375 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8

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