RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	TP53INP1	Q96A56	240 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	HHIP	Q96QV1	700 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	CEP135	Q66GS9	1140 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	FBF1	Q8TES7	1133 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	PBX4	Q9BYU1	374 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	NFKBIE	O00221	500 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	NOS3	P29474	1203 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	EHD4	Q9H223	541 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	7.3	□□□□□ -1.24	4e-12	■□□□□ 11.3
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	FGD1	P98174	961 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	FAM161B	Q96MY7	647 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	PARP2	Q9UGN5	583 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	METTL12	A8MUP2	240 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	GRM2	Q14416	872 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	SETDB1	Q15047	1291 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	NXPE3	Q969Y0	559 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	BCO2	Q9BYV7	579 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	MUC3B	Q9H195	1237 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF428	Q96B54	188 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	TCF12	Q99081	682 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	SPG7	Q9UQ90	795 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	PPME1	Q9Y570	386 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	GNA15	P30679	374 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	GRIA4	P48058	902 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	PSMD2	Q13200	908 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	CCNJL	Q8IV13	435 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334		F8W735	103 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	DAB2	P98082	770 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	LCE3B	Q5TA77	95 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	PTPRA	P18433	802 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	CDC25B	P30305	580 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	FCGRT	P55899	365 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	TMC4	Q7Z404	712 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	C12orf49	Q9H741	205 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	MRS2	Q9HD23	443 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	ABCB6	Q9NP58	842 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334		A0A096LPE4	126 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334		A0A1W2PPZ6	126 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	FAM177B	A6PVY3	158 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	LINC01387	J3KSC0	135 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	ALX3	O95076	343 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	CDC27	P30260	824 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	ARTN	Q5T4W7	220 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334		Q6ZS46	218 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	BSND	Q8WZ55	320 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	FRMD6	Q96NE9	622 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	AK5	Q9Y6K8	562 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	UNCX	A6NJT0	531 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	BTBD11	A6QL63	1104 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	GIPC1	O14908	333 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	SORBS3	O60504	671 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	USP17L7	P0C7H9	530 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	EPHA1	P21709	976 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		7.23	□□□□□ -1.25

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