RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 GRIPAP1Q4V328 841 aa29.36■■■□□ 2.29
NME4-209ENST00000460297 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
NME4-209ENST00000460297 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
NME4-209ENST00000460297 RTKN2Q8IZC4 609 aa29.35■■■□□ 2.29
NME4-209ENST00000460297 EYA3Q99504 573 aa29.35■■■□□ 2.29
NME4-209ENST00000460297 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.35■■■□□ 2.29
NME4-209ENST00000460297 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa29.35■■■□□ 2.29
NME4-209ENST00000460297 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
NME4-209ENST00000460297 IL1R1P14778 569 aa29.34■■■□□ 2.29
NME4-209ENST00000460297 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa29.34■■■□□ 2.29
NME4-209ENST00000460297 IL25Q9H293 177 aa29.34■■■□□ 2.29
NME4-209ENST00000460297 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
NME4-209ENST00000460297 HIP1O00291 1037 aa29.33■■■□□ 2.29
NME4-209ENST00000460297 SOGA3Q5TF21 947 aa29.33■■■□□ 2.29
NME4-209ENST00000460297 FAM227BQ96M60 508 aa29.33■■■□□ 2.29
NME4-209ENST00000460297 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa29.32■■■□□ 2.28
NME4-209ENST00000460297 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa29.32■■■□□ 2.28
NME4-209ENST00000460297 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
NME4-209ENST00000460297 TICAM2Q86XR7 235 aa29.32■■■□□ 2.28
NME4-209ENST00000460297 COA1Q9GZY4 146 aa29.32■■■□□ 2.28
NME4-209ENST00000460297 BCS1LQ9Y276 419 aa29.32■■■□□ 2.28
NME4-209ENST00000460297 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
NME4-209ENST00000460297 SLFNL1Q499Z3 407 aa29.31■■■□□ 2.28
NME4-209ENST00000460297 PSMD1Q99460 953 aa29.31■■■□□ 2.28
NME4-209ENST00000460297 A0A0D9SFI3 127 aa29.31■■■□□ 2.28
NME4-209ENST00000460297 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
NME4-209ENST00000460297 SUPT20HQ8NEM7 779 aa29.31■■■□□ 2.28
NME4-209ENST00000460297 IDH1O75874 414 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
NME4-209ENST00000460297 DOK7Q18PE1 504 aa29.3■■■□□ 2.28
NME4-209ENST00000460297 JAG2Q9Y219 1238 aa29.3■■■□□ 2.28
NME4-209ENST00000460297 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
NME4-209ENST00000460297 SGSM2O43147 1006 aa29.29■■■□□ 2.28
NME4-209ENST00000460297 KIAA2012Q0VF49 1180 aa29.28■■■□□ 2.28
NME4-209ENST00000460297 AOC3Q16853 763 aa29.28■■■□□ 2.28
NME4-209ENST00000460297 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP29.28■■■□□ 2.285e-7■■■□□ 15.7
NME4-209ENST00000460297 RUFY2Q8WXA3 655 aa29.28■■■□□ 2.28
NME4-209ENST00000460297 SYT17Q9BSW7 474 aa29.28■■■□□ 2.28
NME4-209ENST00000460297 ABCF2Q9UG63 623 aa29.28■■■□□ 2.28
NME4-209ENST00000460297 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa29.26■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa29.26■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 DBNDD1Q9H9R9 158 aa29.26■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 LRP2BPQ9P2M1 347 aa29.26■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 ADD2P35612 726 aa29.25■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 MAP3K12Q12852 859 aa29.25■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 WDR66Q8TBY9 1149 aa29.25■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 SCN9AQ15858 1988 aa29.25■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 SALL1Q9NSC2 1324 aa29.25■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 PPIP5K2O43314 1243 aa29.25■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 PDE6AP16499 860 aa29.25■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa29.25■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 FAM205AQ6ZU69 1335 aa29.24■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 RAD50Q92878 1312 aa29.24■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 G3V3G9 751 aa29.24■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 DCAF8Q5TAQ9 597 aa29.24■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 PODNQ7Z5L7 613 aa29.24■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa29.23■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa29.23■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 OSBP2Q969R2 916 aa29.23■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 ZNF532Q9HCE3 1301 aa29.23■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 NFKBIEO00221 500 aa29.22■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 ECE2O60344 883 aa29.22■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 REC8O95072 547 aa29.22■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 PRDX5P30044 214 aa29.22■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 GTF2IP78347 998 aa29.22■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 UBE3CQ15386 1083 aa29.22■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 MAGEB6Q8N7X4 407 aa29.22■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 HELLSQ9NRZ9 838 aa29.22■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 COL4A5P29400 1685 aa29.22■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa29.21■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 APPBP2Q92624 585 aa29.21■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 TAOK3Q9H2K8 898 aa29.21■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 RAI14Q9P0K7 980 aa29.21■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 ERICH6Q7L0X2 663 aa29.21■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 ZNF384Q8TF68 577 aa29.21■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 VPS33BQ9H267 617 aa29.21■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 ANO2Q9NQ90 1003 aa29.21■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 KCNQ5Q9NR82 932 aa29.21■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 MAST3O60307 1309 aa29.2■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 MAST2Q6P0Q8 1798 aa29.2■■■□□ 2.27
NME4-209ENST00000460297 GRIK5Q16478 980 aa29.2■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa29.2■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 USP26Q9BXU7 913 aa29.2■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 M0R2C6 588 aa29.19■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 MFSD14BQ5SR56 506 aa29.18■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 TTLL5Q6EMB2 1281 aa29.18■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 IARSP41252 1262 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 MECOMQ03112 1051 aa29.18■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
NME4-209ENST00000460297 LARGE2Q8N3Y3 721 aa29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms