RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-204ENST00000452765 MED23Q9ULK4 1368 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-204ENST00000452765 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-204ENST00000452765 KLHL34Q8N239 644 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-204ENST00000452765 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2-204ENST00000452765 KCNA3P22001 575 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2-204ENST00000452765 ATP2B4P23634 1241 aa25.18■■□□□ 1.62
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SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC171Q6TFL3 1326 aa25.17■■□□□ 1.62
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SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.16■■□□□ 1.62
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SH3BP2-204ENST00000452765 RASEFQ8IZ41 740 aa25.15■■□□□ 1.62
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SH3BP2-204ENST00000452765 RAI14Q9P0K7 980 aa25.12■■□□□ 1.61
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SH3BP2-204ENST00000452765 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.07■■□□□ 1.6
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SH3BP2-204ENST00000452765 ARMT1Q9H993 441 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-204ENST00000452765 IL1R1P14778 569 aa25.06■■□□□ 1.6
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SH3BP2-204ENST00000452765 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.06■■□□□ 1.6
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SH3BP2-204ENST00000452765 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.05■■□□□ 1.6
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SH3BP2-204ENST00000452765 PRKAB2O43741 272 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-204ENST00000452765 GTF2IP78347 998 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-204ENST00000452765 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-204ENST00000452765 AOC3Q16853 763 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-204ENST00000452765 LCORLQ8N3X6 602 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-204ENST00000452765 AIDAQ96BJ3 306 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-204ENST00000452765 SNED1Q8TER0 1413 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-204ENST00000452765 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
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