RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448188.1

SNORD57-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 57, humanhuman

BASIC

Gene SNORD57, Length 72 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD57-201ENST00000448188 PRDM7Q9NQW5 492 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 RAB6BQ9NRW1 208 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 KCTD3Q9Y597 815 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 CHD6Q8TD26 2715 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 ITPR3Q14573 2671 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa0.47□□□□□ -2.33
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SNORD57-201ENST00000448188 DESI1Q6ICB0 168 aa0.46□□□□□ -2.34
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SNORD57-201ENST00000448188 CAPN12Q6ZSI9 719 aa0.46□□□□□ -2.34
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SNORD57-201ENST00000448188 SP8Q8IXZ3 490 aa0.46□□□□□ -2.34
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SNORD57-201ENST00000448188 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP0.45□□□□□ -2.34
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SNORD57-201ENST00000448188 SLC23A3Q6PIS1 610 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD57-201ENST00000448188 ARMC2Q8NEN0 867 aa0.45□□□□□ -2.34
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SNORD57-201ENST00000448188 MISP3Q96FF7 219 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD57-201ENST00000448188 TBC1D32Q96NH3 1257 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD57-201ENST00000448188 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
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SNORD57-201ENST00000448188 CTNND2Q9UQB3 1225 aa0.45□□□□□ -2.34
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SNORD57-201ENST00000448188 FASNP49327 2511 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
SNORD57-201ENST00000448188 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
SNORD57-201ENST00000448188 IGSF10Q6WRI0 2623 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD57-201ENST00000448188 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
SNORD57-201ENST00000448188 TMEM265A0A087WTH1 108 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD57-201ENST00000448188 ESPNB1AK53 854 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD57-201ENST00000448188 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa0.44□□□□□ -2.34
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SNORD57-201ENST00000448188 DLG4P78352 724 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD57-201ENST00000448188 CENPCQ03188 943 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD57-201ENST00000448188 SPEM2Q0P670 501 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD57-201ENST00000448188 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
SNORD57-201ENST00000448188 NFKBIBQ15653 356 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD57-201ENST00000448188 SGO2Q562F6 1265 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD57-201ENST00000448188 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
SNORD57-201ENST00000448188 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD57-201ENST00000448188 FERMT3Q86UX7 667 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD57-201ENST00000448188 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
SNORD57-201ENST00000448188 CSRNP3Q8WYN3 585 aa0.44□□□□□ -2.34
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