RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM160A1Q05DH4 1040 aa21.36■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.36■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.36■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.36■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.35■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 GSDMDP57764 484 aa21.34■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 FSIP1Q8NA03 581 aa21.34■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM51Q9NW97 253 aa21.34■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.34■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.34■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.34■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.34■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 ST7Q9NRC1 585 aa21.34■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 BTG4Q9NY30 223 aa21.34■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.33■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 NBPF11Q86T75 865 aa21.33■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.33■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 E7EWF7 191 aa21.33■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.33■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 L2HGDHQ9H9P8 463 aa21.33■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 PAG1Q9NWQ8 432 aa21.33■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 NPHP1O15259 732 aa21.32■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM193AP78312 1265 aa21.32■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 TIMM10P62072 90 aa21.32■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 IMPACTQ9P2X3 320 aa21.32■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 DSCC1Q9BVC3 393 aa21.31■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHA7Q9UN72 937 aa21.31■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 PALLDQ8WX93 1383 aa21.31■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.31■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1B0GVL5 298 aa21.3■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 CASP7P55210 303 aa21.3■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa21.3■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa21.3■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.3■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 GLI3P10071 1580 aa21.3■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.3■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC93Q567U6 631 aa21.3■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.3■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 SDF4Q9BRK5 362 aa21.3■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 SHANK3Q9BYB0 1731 aa21.29■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBTB22O15209 634 aa21.29■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 ATL3Q6DD88 541 aa21.29■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.29■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.29■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRN4CLQ8ND94 238 aa21.29■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 ERICH4A6NGS2 130 aa21.29■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.29■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.29■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 TIGD1Q96MW7 591 aa21.29■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 MAST3O60307 1309 aa21.28■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.28■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 NDUFA8P51970 172 aa21.28■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 SYT10Q6XYQ8 523 aa21.28■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.28■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 ARMCX5Q6P1M9 558 aa21.28■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 FHOD1Q9Y613 1164 aa21.28■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.27■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 FOXO4P98177 505 aa21.27■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC150Q8NCX0 1101 aa21.27■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
RALGPS1-208ENST00000424082 CLCN6P51797 869 aa21.26■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 ADALQ6DHV7 355 aa21.26■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 TMC6Q7Z403 805 aa21.26■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.26■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa21.26■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP21.26■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 CLIC4Q9Y696 253 aa21.26■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 NBPF26B4DH59 902 aa21.25■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 NBPF14Q5TI25 921 aa21.25■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 NBPF15Q8N660 670 aa21.25■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 M0R2C6 588 aa21.25■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNJ6P48051 423 aa21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms