RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.47■■□□□ 1.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SAMD7Q7Z3H4 446 aa21.47■■□□□ 1.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.46■■□□□ 1.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PSME4Q14997 1843 aa21.46■■□□□ 1.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HMMRO75330 724 aa21.46■■□□□ 1.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MMP14P50281 582 aa21.46■■□□□ 1.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 JAG2Q9Y219 1238 aa21.46■■□□□ 1.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.46■■□□□ 1.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A0A1B0GUL7 405 aa21.45■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.45■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.45■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HDAC9Q9UKV0 1011 aa21.45■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EGFRP00533 1210 aa21.44■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.44■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CNTROBQ8N137 903 aa21.44■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TIMM10P62072 90 aa21.43■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CERS5Q8N5B7 392 aa21.43■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADORA1P30542 326 aa21.42■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa21.42■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERC1Q8IUD2 1116 aa21.42■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.42■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.42■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CREBZFQ9NS37 354 aa21.42■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.42■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PASKQ96RG2 1323 aa21.41■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 XAGE2Q96GT9 111 aa21.41■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPR108Q9NPR9 543 aa21.41■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa21.41■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 F8W031 263 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SEMA3EO15041 775 aa21.4■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PHKA1P46020 1223 aa21.4■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GORABQ5T7V8 394 aa21.4■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC102BQ68D86 513 aa21.4■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.4■■□□□ 1.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TNNI3KQ59H18 835 aa21.39■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TNS4Q8IZW8 715 aa21.39■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GGA3Q9NZ52 723 aa21.39■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.39■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.39■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SCARF1Q14162 830 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDC37L1Q7L3B6 337 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CRBNQ96SW2 442 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZBTB22O15209 634 aa21.37■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WNT10BO00744 389 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DLGAP5Q15398 846 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RASGRF1Q13972 1273 aa21.35■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.35■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KRT26Q7Z3Y9 468 aa21.35■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SULF1Q8IWU6 871 aa21.35■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.35■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CNTNAP1P78357 1384 aa21.35■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAST3O60307 1309 aa21.34■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa21.34■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRAF5O00463 557 aa21.34■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAB11FIP3O75154 756 aa21.34■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.34■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CFAP100Q494V2 611 aa21.34■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC158Q5M9N0 1113 aa21.34■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.34■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.34■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIF1BPQ96EK5 621 aa21.34■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.33■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 APBB1O00213 710 aa21.33■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYO1BO43795 1136 aa21.33■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.33■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 USP48Q86UV5 1035 aa21.33■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.33■■□□□ 1.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.32■■□□□ 1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.32■■□□□ 1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPDYE6P0CI01 402 aa21.32■■□□□ 1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GRIK5Q16478 980 aa21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms